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生物进化的证据最早出现的生物是单细胞生物，它们生活在原始海洋中藻类和无脊椎动物时代真核生物出现，有性生殖，后代变异多寒武纪大爆发，出现了三级系统蕨类植物、鱼类时代两栖类、爬行类时代裸子植物爬行类时代被子植物哺乳类时代鸟类哺乳类被子植物爬行类两栖类鱼类裸子植物蕨类植物苔藓植物扁形动物藻类植物单细胞生物一、古生物学证据 古生物学是研究各地质时期不同地层的古代生物遗体和遗迹（如足印等）的科学。通过研究可以了解生物在悠长的地质年代中发展的历史；了解生物与环境变迁的相互关系。 由于古生物学对生物进化能提供直接的证据，因此它对生物进化论的形成和发展都有重大的作用。 根据不同地层时期所发现的古生物化石，可以看出各类生物的出现具有一定的时间顺序。 二、胚胎学证据 胚胎学是进化论的坚实基础，贝尔比较不同脊椎动物胚胎发育的状况，得出几个重要的结论。 第一，在胚胎发育中，每一较大动物类群的共同性状先出现，特殊性状后出现。例如，门的性状（如脊索、鳃裂等）先出现。 第二，从最共同的性状中发展出比较不共同的性状，最后才出现最专门的性状。例如，物种的性状最后出现。 第三，不同纲动物的胚胎发育起初经过相似的阶段，以后才愈来愈分坡了。例如，不同纲的胚胎起实阶段是相似的。 第四，在胚胎发育过程中，高等动物胚胎发育阶段经历着低等动物的胚胎发育的阶段。 生物进化胚胎学证据胚胎发育过程简单、快速重演祖先某些进化历程。如脊椎动物早胚出现的鳃的裂、尾胚胎第24天胚胎第3月胚胎第28天三、比较解剖学证据（同源器官）同源器官证明生物进化 同源器官（homologous organs），就是起源相同、构造和部位相似而形态和机能不同的器官。 同源器官最典型的例子是脊椎动物的四肢，如鸟的羽翼、蝙蝠的膜翅、鲸鱼的前鳍都能和人手，马脚一一相较。 同源器官
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