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核 酸i
核酸概述;RNA
含D-核糖,尿嘧啶
与遗传信息的表达及其调控有关
常以单链形式存在
分布:
真核细胞细胞核、细胞质
原核细胞的质区
叶绿体、线粒体
RNA病毒
种类
tRNA
rRNA
mRNA
辅助RNA
病毒RNA;核 苷 酸;核苷酸的类型
常见于核酸的核苷酸
DNA:dA、dT、dG、dC
RNA:A、U、G、C
其他核苷酸类型
三磷酸核苷酸:高能磷酸化合物,能量货币
环核苷酸:第二信使
稀有碱基核苷酸
核苷酸的连接
核苷酸通过3’,5’-磷酸二酯键连接形成核酸,有方向性
一条核酸链有一个5’末端,一个3’末端
核酸内部的核苷酸排列方式称核酸一级结构,书写规则如下:
5’?3’,用直线代表核糖(脱氧核糖), 5’在下方、碱基在上方,P表示磷酸,OH表示羟基
简式:直接用碱基符号代表核苷酸,表明末端磷酸化情况;DNA的结构与功能;DNA的二级结构
DNA二级结构的证据
Chargaff规则
电位滴定行为
X射线衍射
双螺旋结构要点
两条反向平行多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕
嘌呤与嘧啶碱基在内侧,碱基平面与纵轴垂直,磷酸与核糖在外侧,糖环平面与纵轴平行,右手螺旋
双螺旋平均直径为2nm,碱基堆积距离为0.34nm,两核苷酸间夹角为36?,每一圈10个核苷酸,螺距为3. 4nm
两条链通过碱基配对,由疏水作用和氢键维系在一起,两条链对应位置核苷酸按A-T,G-C互补配对, A与T形成两个氢键,G与C形成三个氢键 ,为双螺旋结构主要侧向稳定力
碱基平面之间的疏水力(碱基平面堆积力)为主要纵向稳定力
由于两链间的相互缠绕,双螺旋表面形成大沟和小沟(Groove);DNA双螺旋结构的不同类型
A型:相对湿度75%条件下DNA的结构,螺体宽而短,碱基对与中心轴之间形成19?倾角,RNA与DNA杂合双链也呈A型
B型:相对湿度92%条件下DNA的结构,为标准的双螺旋。
Z型:左手螺旋,只有明显大沟,小沟在结构上几乎不可见。某些癌细胞的DNA,表达活跃的DNA中常有Z型构象存在
三股螺旋:在某些富含嘌呤的区段,如果临近的区域有富含嘧啶的区域,或有外源性的与其互补的寡聚核苷酸链,就可以形成三股螺旋;DNA的三级结构
超螺旋结构
DNA分子可以在双螺旋的基础上,进一步绕同一中心轴扭转,造成额外的螺旋
环??分子的额外螺旋可以形成超螺旋
超螺旋可以是右手螺旋(正超螺旋),也可以是左手螺旋(负超螺旋)
对于环状分子而言,有其拓扑学上特定规律:L=T+W
其他三级结构
与蛋白质结合形成复合体(病毒)
直接与蛋白质结合
可以进一步形成高级结构
核小体结构
真核细胞染色体
与组蛋白结合;DNA的高级结构
原核生物染色体
没有组蛋白,没有骨架蛋白
其上一般有DNA聚合酶,RNA聚合酶
有操纵子结构
与mRNA、核糖体、未成熟的蛋白质并存
真核生物染色体
与组蛋白结合形成核小体结构,并进一步装配与核骨架蛋白结合形成染色体
有非组蛋白与DNA结合,实现对基因表达的调控
基因结构更为复杂
不与mRNA、核糖体直接接触
染色体外DNA分子
质粒,cccDNA
细胞器DNA;DNA的生物学功能
主要生物学功能
以核苷酸碱基序列的形式储存遗传信息
通过复制在亲代与子代间传递遗传信息
作为模板指导mRNA的合成,表达遗传信息
证明DNA是遗传物质的实验
Avery,转化实验
Conrat,植物病毒拆分重建实验
Hershey Chase,噬菌体感染实验;RNA的结构与功能;mRNA
结构特点
线状分子,分子量差异大,寿命较短
原核生物的mRNA是多顺反子(多个基因转录到一个mRNA分子上),编码多个蛋白质
真核生物的mRNA是单顺反子(一个基因转录到一个mRNA分子上),只编码一条肽链
真核生物的mRNA分子存在5’-帽子结构和多聚A尾巴
5’-帽子结构:真核mRNA 5’-末端的特殊结构,一般5’-末端为m7Gppp-,后面含若干修饰碱基。
Ploy-A尾:真核mRNA 3’-末端的特殊结构,长度不等的多聚腺苷酸。
mRNA功能
以DNA为模板,传递遗传信息
参与蛋白质表达的调控;tRNA
一级结构特点
由70-90个核苷酸组成,分子量25Kd,沉降系数4S左右
5’-端大多为pG,少数pC
3’-端为CpCpAOH,可以接受活化的Aa,称接受末端
含有较多的稀有碱基
二级结构特点
分子内部,部分碱基互补配对,使整个分子形成由“臂”和“环”组成的三叶草形结构
氨基酸臂:通常7对碱基构成,富含G,包含两个末端,3’-末端的CCA未参与配对,呈单链状态,可以接受活化的Aa
二氢尿嘧啶环(D环):8-12个核苷酸构成,含2个二氢尿嘧啶,通过由3-4对碱基构成的双螺旋区(二氢尿嘧啶臂)与其他部分相连。;反密码环:7个核苷酸构成,中部为反密码子,常含次黄嘌呤核苷酸,通
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