建立分支dna技术用于hbv dna定量并评价微阵列芯片检测hbv耐药的性能特点-establish branched dna technology to quantify hbv dna and evaluate the performance characteristics of microarray chip in detecting hbv drug resistance..docxVIP

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建立分支dna技术用于hbv dna定量并评价微阵列芯片检测hbv耐药的性能特点-establish branched dna technology to quantify hbv dna and evaluate the performance characteristics of microarray chip in detecting hbv drug resistance.

万方数据 万方数据 目 录 英汉缩略名词对照表 2 中文摘要 4 英文摘要 7 研究内容 第一部分 建立分支 DNA 技术定量检测 HBV DNA 及初步临床应用 一、前 言 10 二、材料和方法 13 三、结 果 20 四、讨 论 33 第二部分 DNA 微阵列芯片技术在乙肝病毒耐药基因检测中的应用及其评价 一、前 言 35 二、材料和方法37 三、结 果 41 三、讨 论 45 全文总结 47 参考文献 48 综 述 51 致 谢 61 2 英汉缩略语名词对照 (Abbreviation) 英文缩写 英文全称 中文名称 ADV Adefovir Dipivoxil 阿德福韦酯 bDNA Branched DNA 分支 DNA bp Base pair 碱基对 cccDNA covalently-closed circular DNA 共 价 闭 合 环 状 DNA CHB Chronic viral hepatitis type B 慢性乙型肝炎 Ct Cycle threshold (PCR 荧光信号) 阈值循环数 CT Chlamydia trachomatis 沙眼衣原体 CV Coefficient of variation 变异系数 DNA Deoxyribonucleic acid 脱氧核糖核酸 EDTA Ethylenediaminete traacetic acid 乙 二 胺 四乙酸 ETV Entecavir 恩替卡韦 HBV Hepatitis B Virus 乙型肝炎病毒 HCV Hepatitis C Virus 丙型肝炎病毒 HEPES 4- (2- Hydroxyethyl)- 1- piperazineethanesulfonic acid 4-羟 乙 基哌 嗪 乙 磺酸 HPV Human papillomavirus 人 乳 头 瘤病毒 HSV Herpes simplex virus, 单 纯 疱 疹病毒 3 IFN Interferon 干扰素 LAM LdT Lamivudine Telbivudine 拉米夫定 替比夫定 MALDI- TOF MS matrix assisted laser desorp tion/ionization time-of-flight mass spectrometry 基质辅助激光解 吸电离飞行时间 质谱 min Minute 分钟 mg Milligram 毫克 NUCs nucleostide analogues 核苷酸类似物 ORF Open Reading Frame 开放读码框 RFLP restriction fragment length polymorphism 限制性片段长度 多态性 Rnasin RNA inhibitor 核糖核酸酶抑制 剂 rpm rotate per minute 每分钟转速 RT-qPCR Real-time Fluorescent Quantitative Polymerase Chain Reaction 实时荧光定量聚 合酶链反应 SDS Sodium Dodecyl Sulfate 十二烷基硫酸钠 4 建立分支 DNA 技术用于 HBV DNA 定量并评价微阵 列芯片检测 HBV 耐药的性能特点 中 文 摘 要 目的 1. 建立分支 DNA 信号放大技术(branched DNA, bDNA)定量检测乙型肝 炎病毒 DNA(Hepatitis B Virus DN A, HBV DNA),并评价其性能特点及其临床 应用价值,为将该技术应用于 HBV 感染的诊断和疗效判断奠定基础。 2. 评价 DNA 微阵列芯片法检测慢性乙型肝炎拉米夫定和阿德福韦酯耐药 突变的性能特点及其临床应用价值。 方法 1. 根据文献报道的中国HBV B、C型基因组全序列,设计一套碱性磷酸酶标 记的探针,包括:捕获探针组、特异性捕获剂、标记体、前放大体探针组、放大 体探针组和标记探针组,将捕获探针包被在96孔聚氯乙烯板上,依序与HBV DNA、前放大体探针组、放大体探针组、标记探针组杂交,将杂交信号级联放 大,用北京源德生物有限公司JETLIA-962型发光仪检测化学发光信号值,计算 结果。 2. 制备标准品:收集 5 例高 HBV DNA 载量的 HBV 感染者血清标本共 5 ml 作为标准品,用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time Fluorescent Quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法连续 4 天对其 HBV DNA 进行定量,共 定量 20 次,其平均值 1.87E+08 c

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