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2018-06-02 发布于江苏
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大规模计算在生命科学中的应用.pdf

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赵勇 * 计算量大比如基因序列比对，需处理数十亿基因序列 * 计算度复杂很多应用涉及几十个流程，单机需运行上月甚至数年 * 控制参数多参数的选择很重要，经常需要进行参数扫描过程 * 结果需可视化很多结果以可视化方式呈现 * 大规模任务计算（Many Task Computing ）任务之间是独立的，或是松散耦合的任务数目巨大输入数据大任务计算时间相对较短大小数据分析挖掘大数据和很多任务中传统 MPI任务很多松散耦合应用小 1 1千 1百万任务数量 *CPU 计算性能高速增长 *CPU核的数目不断增长，制造过程不断简化 300 100 90 250 80 70 量200 程数 60 过的150 50 造核 40 制 100 30 核的数量 20 50 过程