变性高效液相色谱分析猪gh基因单核苷酸多态性及与生产性能的关系.docVIP

变性高效液相色谱分析猪GH基因单核苷酸多态性及与生产性能的关系 ? 20?AnimalHusbandryamp;VeterinaryMedicine2007Vo1.39No.4 变性高效液相色谱分析猪GH基因单核苷酸 多态性及与生产性能的关系 王荣梅,苏荣胜,张姻权n,杨关福 (1.韶关学院英东生物工程学院农业工程系,广东韶关512005; 2.华南农业大学兽医学院,广东广州510642: 3.华南农业大学动物科学学院,广东广州510642) 摘要:选取参考家系资源群体共357个个体作为试验材料,采用变性高效液相色谱(DHPLC)技术,在猪生长激素(GH)基因包含第5外显子 区的572bp序列进行未知SNPs的筛选,对有变异的色谱峰型进行分类,测序,结果发现在该区域有4处变异,其中+1579位点的变异可以用基 因型频率(AA,AB,BB)和基因频率来估算.对该位点变异与生产性能进行相关性分析得到不同基因型个体与参考家系中的测定重,体长,体 高,胸宽,胸围,腿臀围,胴体A,B,c点膘厚,平均膘厚等生产性能之间没有显着差异;但BB基因型个体的测定重,体长,体高,胸宽,胸 围都高于AA和AB基因型个体;BB基因型个体的腿臀围,胴体A,B,c点膘厚及平均膘厚则均低于AA和AB基因型个体;BB基因型个体的断 奶后日增重显着高于AB基因型个体(Plt;0.05),也高于AA基因型个体,但差异未达到显着水平;BB基因型个体达100kg日龄显着低于AB基 因型个体(Plt;0.05),比AA基因型个体达100kg日龄也低,但它们之间的差异不显着. 关键词:变性高效液相色谱;猪;GH基因;单核苷酸多态性;生产性能 中图分类号:$828.2文献标识码:A文章编号:0529-5130(2007)04—0020—05 SinglenucleotidepolymorphismsofporcineGHgenesbydenaturing highperformanceliquidchromatographyanditsrelationship withproductionperformance WANGRong.mei., SURong.sheng,ZHANGXi.quan,YANGGuan.fu (1.YingdongCollegeofBio梕ngineering,ShaoguanUniversity,Shaoguan512005,China; 2.CollegeofVeterinaryMedicine,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510642,China; 3.CollegeofAnimalScience,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510642,China) Abstract:UsingDHPLCtechnologyunknownSNPsweredetectedin572bpporcineGHgenecontainingthe5thexonin357individuals frompigreferencepopulation.Themutantchromatographictypeweredevidedandsequenced.TheresultsshowedthattherewereSNPsinthe region.Genotype~equence(AA,AB,BB)andgenefrequencecouldbeestimatedatthevarianceof+1579.PolymorphismofSNPin +1579wasconductedinpigreferencepopulation.Accordingtothecorrelationanalysisbetweendifferentgenotypesandproductionperform?ance,onlythedifferencesindaylybodyweightandtheagesupto100kgsbetweengenotypeBBandABweresignificant(Plt;0.05). Keywords:denaturinghighperformanceliquidchromatography(DHPLC);porcine;GHgene;singlenucleotidepolymorphisms (SNPs);productionperformance 生长激素(GH)在多种生理功能中起着重要的作用,特 别是能促进蛋白质的合成并减少其分解.猪的生长激素基因已 定位于12号染色体P区域内…,由5个外显子和4个内 含子组成,转录区长约107kb.目前对该基因的遗传