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二、高等植物基因结构及表达调控 植物生理 讲解材料.ppt
二、高等植物基因结构及表达调控;1、 真核细胞基因组结构的特征;真核生物 rRNA 基因结构; ② 真核基因组是以染色体形式存在,小部分DNA是裸露的。; ④ 真核基因属于断裂基因,编码序列中存在有内含子。;;真核细胞基因表达; 2、植物的基因组;基因组:一个生物遗传物质的总和。
细胞中的全部DNA。; 2.1 植物基因组的复杂性 ; 物 种 碱基对数目/ 物理长度/cm
(×108 bp/细胞); 基因组的序列可分为单一序列(single copy sequence)和重复序列(repetitive sequence);;叶绿体基因组(chloroplast genome):;线粒体基因组(mitochondrial genome); mtDNA有分子内、分子间重组,也可与核、叶绿休基因组DNA重组。因此mtDNA的重排、序列加倍、与外源DNA整合的几率很高,由此产生新的嵌合基因。细胞质雄性不育就是由于新的嵌合基因导致的。; 植物细胞内的三类基因组存在着广泛的相互作用。
叶绿体和线粒体的结构蛋白多数由核基因组编码:细胞器基因 转移至核基因组;
在三种不同的基因组中存在有同源DNA——“混源DNA”;
也有基因从核基因组转移至细胞器基因组——核糖体L23蛋白质基因。; 叶绿体、线粒起源:马古利斯的内 共生理论。; 2.2 基因组学简介;; 世界上有三大基因序列数据库:
美国“国家生物技术信息中心”(NCBI)主持的Gene Bank:
http///;基因的命名:; 根据突变型的表型命名:基因名称与正常功能相反;
矮化基因——高生长基因; 3 植物基因的结构;;文
库
的
构
建; 构建基因文库的目的主要是为了直接从基因组中分离目的基因,有了基因文库后,目的基因的制备可以理解为从基因文库中“钓出”目的基因。;核酸分子杂交;;; ② 根据蛋白质测序结果,合成一对 PCR 引物,以植物总DNA为模板,扩增出目标基因片段,以此片段为探针,从基因组文库与 cDNA文库中分别钓出编码该蛋白质的基因与 cDNA克隆。; ③ 基因产物不明,但知道基因突变后的表型,可用转座子标签法分离基因。 ; ④ 利用RFLP图谱,找出与所要克隆基因紧密连锁的分子标记,用染色体步行法找到所要克隆的基因。 ; ⑤ 如果该基因受某种因素诱导表达,可用mRNA差异显示法找到所要克隆的基因。
⑥ 核DNA减法克隆。利用缺失突变体与同源亲本1~2DNA片段的差异克隆目的基因。; 克隆到基因与cDNA后,测序,对比基因全序列与 cDNA序列,了解基因结构:如转录起始位点,内含子数量、位置及长度,终止密码与加尾信号的位置等。
通过对比研究,表明植物基因结构与其它真核基因结构相似,主要由 5’上游区、5’非翻译区、编码区、3’非翻译区4个结构区域组成。;5’上游区; 3.1 5’上游区:; ② 在上游 –32 ?7有一段TCACTATATAG一致顺序:简称:TATA box。
该序列是RNA聚合酶II起始转录所必需的。; ③ 在5’远上游区,存在对基因表达有增强或抑制作用、决定基因表达特定时空顺序以及对激素和外界胁迫起应答作用的序列——
顺式作用元件(cis-acting element); 3.2 5’非翻译区:; 3.3 编码区:;; ;内含子共有4种,具有核酶性质:
I 类内含子:主要存在于rRNA和质体tRNA基因
中,中间部分高度保守;
II 类内含子:主要存在于线粒体和质体mRNA基
因中,拼接点的序列高度保守;
III 类内含子:主要存在于核mRNA基因中;
IV 类内含子:存在于核tRNA基因中;; 3.4 3’非翻译区:;前导区; 4
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