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c-2c2-h-2c2-型锌指蛋白——znfd的生物学功能初探
中文摘要
C2H2型锌指基因是高等动物基因组中最大且最复杂的基因超家族,在人与小
鼠基因组中拥有数百个成员。本实验室使用生物信息学分析,并结合NCBI数据库
筛选得到一人源锌指基因ZNFD,基因号为NM
信息学方法分析,结果表明ZNFD为C2H2型锌指蛋白的一员,该锌指基因尚未见
相关研究,故本实验室对该基因展开了以下几个方面的初步研究。
序鉴定ZNFD基因序列的正确性。利用生物信息学方法对ZNFD基因和蛋白进行
eDNA由5个外
分析,表明ZNFD基因位于第5号染色体,定位在5q23.1。ZNFD
显子和4个内含子组成,含有990bp的开放阅读框,编码一个由329个氨基酸组
在前列腺、睾丸、脑、胰、子宫中表达,且睾丸和脑组织中表达量较高。通过生
物信息学软件CLUSTALW分析7种物种的ZNFD基因的同源性,分析表明目的
蛋白的17.260aa有较高的保守性。
ZNFD蛋白定位于细胞核。同时为了鉴定ZNFD蛋白的N端氨基酸序列与锌指模
序对ZNFD蛋白细胞核定位的影响,分别构建了一系列截短型ZNFD与绿色荧光
明了ZNF结构域对于ZNFD蛋白的核定位不是必须的。
大量研究证明ZNF蛋白多为转录因子,因此,本文进一步对ZNFD在特定的
信号通路中是否有转录调控作用进行了分析。运用Dual.荧光酶报道基因分析系统
件,该质粒专门用来监控蛋白激酶C转导路径的转录调控作用。这说明ZNFD可
能作为蛋白激酶C信号途径的转录激活因子来介导调控细胞的一系列功能。另外,
串联亲和纯化(TAP)为一种两步亲和纯化方法,该方法适用于分离类似生理条件
中文摘要 CaH2型锌指蛋白—-zNFD的生物学功能初探
下的蛋白互作复合体,因此我们构建了TAP.ZNFD真核表达载体,为后续寻找
ZNFD互作蛋白奠定基础。
关键词:ZNFD,C2H2型锌指蛋白,APICPMA),转录激活
作 者:雷陈
指导老师:王明华
吴士良
ll
Initial oftheFunctionofZNFD--aZinc Protein Abstract
C2H2-type
Exploration Finger
Initial oftheFunctionofZNFDma
Exploration
Zinc Protein
C2H2—-typeFinger
Abstract
zinc areoneofthe andmost
C2H2 finger(C2H2-ZNF)geneslargest complexgene
in
inmetazoan hundredsofmembersthehumanand
super-families genomes,with
mouse anovelhumanzinc ZNFD
genome.Wegot fingergene by
ID 1.The
andNCBIdatabase is
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