六单元核酸2.pptxVIP

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  • 2018-06-01 发布于上海
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六单元核酸2

第12章 核酸通论第13章核酸的结构第14章核酸的物理化学性质第15章核酸的研究方法1 核苷酸2 核酸的共价结构3 DNA的高级结构4 RNA的高级结构1 核苷酸1.1 核酸的元素组成主要元素组成: C、H、O、N、P(9~11%)与蛋白质比较,核酸一般不含S,而P的含量较为稳定,占9-11%。 1.2 核酸的基本构成单位:核苷酸(nucleotide)核酸与蛋白质一样,是一种高分子聚合物。它是由结构较简单的小分子有机化合物-核苷酸组成。核苷酸是核酸的基本结构单位。核苷酸由戊糖、磷酸和含氮碱三部分构成1.2.1 戊糖组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为β-D-2-脱氧核糖;RNA所含的糖则为β-D-核糖。核酸中的戊糖都是β-D-型腺嘌呤(adenine, A)鸟嘌呤(guanine, G)1.2.2 碱 基嘌呤(purine)4N53261N尿嘧啶(uracil, U)胞嘧啶(cytosine, C)胸腺嘧啶(thymine, T)嘧啶(pyrimidine)酮式烯醇式互变异构大部分以酮式存在 核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述碱基的甲基化产物。1.2.3 核苷(ribonucleoside)核苷=戊糖+碱基糖与碱基之间的C-N键,称为C-N糖苷键碱基和核糖通过糖苷键连接形成核糖核苷。碱基和脱氧核糖通过糖苷键连接形成脱氧核苷。核苷中戊糖与碱基的连接方式: 嘧啶碱: C1’-N1嘌呤碱: C1’-N9, 嘧 啶 嘌 呤 核糖 脱氧核糖1.2.4 核苷酸(ribonucleotide)的结构与命名核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。 核苷酸=核苷+磷酸 =戊糖+碱基+磷酸核糖核苷酸:AMP, GMP, UMP, CMP脱氧核糖核苷酸:dAMP, dGMP, dTMP, dCMPBaseBase脱氧核糖核苷核糖核苷酸酸2’-核糖核苷酸3’-核糖核苷酸5’-核糖核苷酸3’-脱氧核糖核苷酸5’-脱氧核糖核苷酸游离核苷酸多为5’-核苷酸5′-NMP5′-NDP 5′-NTPN=A、G、C、U5′-dNMP5′-dNDP5′-dNTP N=A、G、C、TAMPADPATP1.2.5 核苷酸衍生物 (1)ATP (腺嘌呤核糖核苷三磷酸)含有两个高能磷酸键。ATP水解可以释放出大量自由能。解释的能量用于推动生物体内各种需能的生化反应。能量转换中间体ATP也是一种很好的磷酰化剂。磷酰化的底物分子具有较高的能量(活化分子),是许多生物化学反应的激活步骤。adenosine (2)GTP (鸟嘌呤核糖核苷三磷酸)也是一种高能化合物。GTP主要是作为蛋白质合成中磷酰基供体。在许多情况下, ATP 和 GTP 可以相互转换。(3) cAMP 和 cGMPcAMP(3’,5’- 环腺苷酸)和 cGMP( 3’,5’-环鸟苷酸)的主要功能是作为细胞之间传递信息的信使。(4) 辅酶 维生素B2-黄素辅酶维生素PP-尼克酰胺辅酶(辅酶I)2 核酸的共价结构2.1核酸中核苷酸的连接方式2.2 DNA的一级结构2.3 DNA与基因组3′端5′端C2.1.1 核酸中核苷酸的连接方式A核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。G5’3’5’3’5?3?5?3?3 ? -5 ?磷酸二酯键2.1.2 多聚核苷酸的特点在多聚核苷酸的连接方式通常称为3?-5?磷酸二酯键多聚核苷酸链一端的C5′带有一个自由磷酸基,称为5′-磷酸端(常用5’-P表示);另一端C3’带有自由的羟基,称为3′-羟基端(常用3’-OH表示)。多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它的方向是5′→3′(由左至右)或是3′→5′。由核糖核苷酸聚合而成的称为RNA;由脱氧核糖核苷酸聚合而成的称为DNA。OH5′5′3′OH3′OHRNA DNAHow polynucleotides are actually formed3′-OH5′-dNTPT 3’5’2.1.3 核酸的表示方式在多聚核苷酸(DNA或RNA)链中,由于构成核苷酸单元的戊糖和磷酸基是相同的,体现核苷酸差别的实际上只是它所带的碱基,所以多聚核苷酸链结构也可表示为: 3’3’3’5’5’5’竖线代表戊糖碳链,P代表磷酸集团,与P相连的斜线带代表3?-5?磷酸二酯键T T C G G A 5? P OH 3?PP PPP5? pApCpTpGpCpT-OH 3? P为磷酸基团5? A C T G C T 3? p5′ ACTGCATAGCTCGA 3′ p p pACTG3′1′字母式OH5′3′线条式5′3′结构式5′3′DNA分子中各脱氧核苷酸之间的连接方式(3′-5′磷酸二酯键)和

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