rbsdv和srbsdv安徽分离物全基因组特征及srbsdvmp基因的功能分析-genome - wide characteristics of rbs dv and srb sdv anhui isolates and functional analysis of srbsdvmp gene.docxVIP

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2018-06-01 发布于上海
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rbsdv和srbsdv安徽分离物全基因组特征及srbsdvmp基因的功能分析-genome - wide characteristics of rbs dv and srb sdv anhui isolates and functional analysis of srbsdvmp gene.docx

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rbsdv和srbsdv安徽分离物全基因组特征及srbsdvmp基因的功能分析-genome - wide characteristics of rbs dv and srb sdv anhui isolates and functional analysis of srbsdvmp gene

20.5%~99.6%、21.6%~100.0%、21.3%~99.8%、21.9%~99.7%和21.3%~99.8%，其中 RBSDV 分离物之间 S1-S10 相似性分别为 53.1%~68.4% 、 65.3%~74.8% 、72.2%~90.5% 、 94.6%~98.6% 、 93.3%~98.5% 、 91.6%~98.6% 、 93.7%~99.4% 、94.0%~99.1%、88.6%~99.7%和93.2%~99.0%，SRBSDV分离物之间S1-S10相似性分别为83.3%~85.3%、67.8%~70.1%、80.5%~99.4%、97.5%~99.5%、98.3%~99.5%、 97.4%~99.6%、99.1%~100.0%、98.9%~99.8%、98.6%~99.7%、98.7%和99.8%，RBSDV 分离物与 SRBDV 分离物之间 S1-S10 的相似性分别为 56.8%~75.3% 、58.3%~68.9% 、 21.2%~23.6% 、 20.5%~22.1% 、 63.2%~65.8% 、 59.6%~62.8% 、66.3%~67.2%、65.0%~67.8%、67.7%~70.2%和73.5%~75.9%。进一步构建S1-S10不同组分的系统关系树，RBSDV与SRBSDV分别聚成各自独立的分支，说明RBSDV和SRBSDV的亲缘关系较远。3SRBSDV mp基因的初步鉴定克隆 SRBSDV S9-2、S7-2 和 S5-2 基因，构建重组表达载体 pBin-S9-2、 pBin-S7-2 和 pBin-S5-2，分别与运动缺陷型 PVX 载体（pPVX-GUS-BSP）共轰击本氏烟叶片。 pBin-S7-2 与 pPVX-GUS-BSP 共轰击本氏烟（ Nicotiana benthamiana）叶片，组织化学染色后直接观察，可见蓝色斑点，在显微镜下观察，发现 GUS 基因编码的蛋白已扩展到多个细胞。而 pBin-S9-2、pBin-S5-2 分别与 PVX-GUS-BSP 共轰击本氏烟则观察不到蓝色斑点。说明 pBin-S7-2 在 35S 启动子驱动下能够互补 PVX-GUS-BSP 的运动功能，因此可以初步认为 SRBSDV S7-2 可能编码运动蛋白。关键词：水稻黑条矮缩病毒；南方水稻黑条矮缩病毒；分子鉴定；全基因组特征；运动蛋白AbstractIn recent years, Rice black-streaked dwarf disease and Maize rough dwarf disease induced by Rice black-streaked dwarf virus (RBSDV) and Southern rice black-streaked dwarf virus (SRBSDV) caused increasingly serious damage in the rice and maize planting areas of Anhui province. However, it was very difficult to distinguish the two viruses in the field samples only by the symptoms. RT-PCR method utilized in our research work can realize one-time detection and identification of two virus species of RBSDV and SRBSDV. To further realize the origin and evolution relationship between RBSDV and SRBSDV, and ascertain the molecular variation and the characteristics of genetic evolution, two isolates of RBSDV and one isolate of SRBSDV in Anhui province containing segment S1-S10, respectively, were cloned and sequenced. n addition, it is the key point of establishing system infection successfully that the plant virus radial move to adjacent cells from sites of infection, whi