markush构造分析与检索系统.pdfVIP

叁整堡上尘!兰塑土。兰垡丝皇————————～ 摘 要 化学专利中普遍应用的Markush结构是由一个新颖的母体基凼和可变取代基组成， 由于可变取代基的复杂性使得Markush结构的检索和匹配成为化学信息学领域的个难 题。本论文在深入研究了现有Markush结构处理方案和本课题组已有研究成果的基础 对稳定的环和环之间的连接片断提取出来构成族性结构的骨架(Scaffold)，考虑到有 显式的确定环(如苯环)和隐式的族性环(如可被取代的芳环)，为了增如『筛选的效 率，根据统计分析的结果将出现频率最高的确定环用一系列代码标识，其余的环结构则 统一族性化处理成脂肪环，芳香环和含有部分芳环的脂肪环，根据是否含有杂原子呵进 一步加以区分。利用SMILES扩展算法程序对环和非环原子，特别是对芳香环原子的识 别算法，实现了结构式的程序分析，删除环上的连接片断，保留了环和环之间的连接片 断，利用程序自动生成了Markush结构的骨架。第二阶段是在每～个骨架结构巴添加非 环的可变取代基，提取其中的官能团信息加以分析归类，作为环的属性描述。用面向对 象程序设计方法(OOP)实现了骨架编码方案的一系列算法，用Java语言完成了能够运 起向导作用。由于骨架环处理方案将环抽象成图的顶点，环之间的连接片断抽象成图的 边，环上的连接片断则对应于图的权重，在匹配阶段避免了复杂耗时的回溯算法，并且 有骨架环的生成由程序实现，适用于药物专利标引，建立供检索的药物专利数据库。本 论文基于Windows2000+IIS5．0平台设计并实现了药物专利Markush结构分析和检索 测试系统。 关键词：Markush结构：SUILES扩展算法；检索系统；药物专利 Mar|(Llsh结构分析与检索系统 Feature andRetrieval Oll Structural Markush Analysis System Study Abstract The retrieval structures and has been the most indexing ofgeneric alwaysamong andthe informationmost this problematicaspects expensive．In ofpatent paper，the problem the for and in posedby storage structuredefinitions requirement manipulationofgeneric patents is and have an reviewed．Chemists ofmethodsof patents agentsdevelopedarmory over decadessothata structure