原子-键电负性均衡融合进分子力场—应用于烷烃和多肽构象的研讨.pdf

原子．键电负性均衡融合进分予力场一应用于烷烃和多肽构象的研究 愿子一键电负性均衡方法融合进分子力场一应用于烧烃秘多肽构蒙的研究 关键词：琢予～键电受往均衡方法，力场，烷烃，多款，构象 摘要 动力学模羧方法已缀藏势探索生物体系蔑律和零质静一释爨癸静工其，莛 模拟的结果很大程度上取决于所采用的分子力场的优劣。目前广泛使用的力场 都存在着～个主要的缺陷，在模拟中忽略了体系中静电极化和电子转移。另外， 嶷该銮羹入豫学键、孤对魄子等电蔫嚣域，寒更热壤确弱计算羚毫势麓，露不怒 只采用原予净电荷。因此许多科学家程不断努力探索和发展新的分子力场，来 有效合理的计算体系随环境变化而引越的静电极化。 已经被广泛应用来处理嚣电极化方法丈体分为：诱导偶极模塑、浮动电磁 模登、诱导锅极与浮动惫懿葙结合懿方法稳Drude搂型。诱导髑辍模墅已经羧 应用到了水体系、分子纯溶液界面和离子通过水和有机界面的自由能计算。 Drude模型也应用到了液态水和离子的水溶液体系中。但是极化力场对生物大分 子豹研究仍|瓣还不够深入。 根据密度泛函理论觏电负性均衡原理建立起来的浮动电荷模鍪，能够克服 固定电荷力场的局限性，井在许多领域取得了满意的结果，尤其是对蛋白质体 系的模拟。Rick等人首先利用浮动电