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医学PPT课件大全非对称基因组学用新的思维解读生命进化之谜
非对称基因组学-用新的思维解读生命进化之谜南京大学 田大成、陈建群 引子耗散结构 -演化中对称破缺的有序结构远离平衡,非对称性,产生有序非平衡是有序之源 Architecture of Genomics 普通基因组学 (Classical Genomics) 功能基因组学 (Functional Genomics) 比较基因组学 (Comparative Genomics) 进化基因组学 (Evolutionary Genomics) 生态基因组学 (Ecological Genomics) 生物医学基因组学(Biomedical Genomics) 蛋白组学 (Proteomics ) 非对称基因组学 (Asymmetric Genomics) 2. 非对称的基因组 对称基因组和普通遗传学 非对称基因组 非对称基因组学 基因组非对称性的意义 例一:非对称的基因组- 同一物种基因组中不对称的基因数量、种类、位置等 例二:玉米的非对称基因序列 基因家族的非对称基因数量 例:水稻抗病基因组 品种1(日本晴)的抗病基因:464个 品种2(9311)的抗病基因: 483个 完全不同的: 105个(22.2%) 不等位且差异大的: 131个(27.7%) 非对称的基因数量: 236个(49.9%) 启示:哪种基因家族更对称(变异大的或小的)? 哪种基因家族对生物的多样性贡献更大? 基因组间非对称基因数量的估计 例1: 水稻基因组-45000个基因 基因组的非对称性:约5-10%, 即1960 P/A+4170 AL个基因完全不同 例2: 玉米基因组 基因组比水稻的更大,且比水稻的更不对称 自交系间4000个?杂种间8000个? 例3:Arabidopsis(拟南芥)-30000个基因 在表达的基因中: 574/7465=7.69% 启示:不同的基因数量对个体间的生物适应性有无贡献? 多一些和少一些基因对人类疾病有什么影响? 3. 非对称基因组的特殊遗传规律 非对称基因的遗传 特殊方式的遗传隔离和交流 特殊方式的遗传重复 非对称基因的遗传 多个非对称基因的遗传 如嗅觉决定基因? 杂种优势的遗传基础 自交退化的遗传基础 显隐性性状的遗传基础 特殊方式的遗传隔离 背景:遗传差异的保存 遗传隔离 ? acumination of mutations Simple principle: Genetic Isolation Genetic exchange 非对称基因间的遗传差异 特殊方式的隔离和重组 非对称基因组的非固定配对和重复 对称与非对称的基因组 特殊的基因重复方式Non-identical Duplication 4. 非对称基因组的进化 非对称基因组的起源 非对称基因组及其遗传差异的保存 非对称基因组的演化 非对称基因组的进化模式 经典的进化模式 对称、稳定 物种内的遗传差异 重复和重组的对称性 基因重复(duplication)非对称基因组的起源 对称和非对称条件下的遗传与变异 非对称基因组的演化非对称进化模型 5. 非对称基因组学 - Unique genetic behavior Shaping forces on genome 描述基因组的非对称状况 物种内非对称基因序列的变异 非对称基因组的特殊遗传规律 非对称基因序列的特殊进化模式 非对称基因组学的意义和应用 非对称基因组学的意义 理论意义 系列新的遗传进化规律 新的分支学科 ? ? ? ? ? ? 实践意义 杂种优势 新的育种方法 疾病防止方法 ? ? ? ? ? ? Acknowledgements 课题1:丁静、张鹏飞、彭贵子、陈玲玲 课题2:张鹏飞、彭贵子、陈玲玲、 周扬、孔令天 课题3:杜建厂、顾婷婷、王强 课题4:杨四海、蒋科、潘春雨、经志强 课题5:孙小琴、杨四海、张秀艳 课题6:王强、顾婷婷、杜建厂 课题7: 张雯、王威 自交 自交-基因的分离和纯合对称基因组的产生 个体1 个体2 杂合体 极端丰富的遗传差异 非对称的重组和重复 非对称的基因组 基因的非对称分化 * * 对称的基因组-经典遗传学赖以成立的基础 基因1 基因2
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