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细胞表位预测
在抗原中基于BP神经网络对B细胞表位预测 刘景林 免疫系统 1、免疫器官(胸腺、骨髓、脾、淋巴结等) 2、免疫组织(黏膜相关的淋巴组织) 3、免疫细胞(吞噬细胞、自然杀伤细胞、 T及B淋巴 细胞等) 4、免疫分子(细胞表面分子、抗体、细胞因子等) 免疫系统的功能 防御功能——保护机体不受损 害,帮助机体消灭外来的细 菌、病毒以及避免发生疾病; 稳定清洁功能——不断清除衰 老死亡的细胞,保持体内的净 化更新; 监控功能——及时识别和清除 染色体畸变或基因突变的细 胞,防止癌瘤的发生。 免疫细胞 1、固有免疫应答细胞(单核-巨噬细胞、自然杀伤细胞、多形核中性粒细胞等) (这类细胞经其表面表达的受体,能识别一种分子,这 种分子表达于多种病原体表面) 2、适应性免疫应答细胞(淋巴细胞) (这类细胞是克隆分布的,每一克隆的细胞,表达一种识别抗原受体,特异识别天然大分子中的具有特殊结构的小分子。) B细胞 未成熟的B细胞可在细胞表面表达IgM(immunoglobulin M,免疫球蛋白M),此后相继表达IgD。当细胞同时表达IgM和IgD时,称为成熟的B细胞,此时可以接受抗原的刺激。成熟的B细胞迁移到脾脏,若未遇抗原刺激,数天后相当数量的B细胞死亡;只有那些获得抗原刺激和获得TH细胞提供刺激信号的B细胞,一部分分化为记忆细胞,大部分分化为分泌抗体的浆细胞。 记忆细胞寿命长,浆细胞寿命短。记忆细胞在血液和淋巴液中循环时,若第二次遇到同样抗原入侵,它将很快分裂为新的记忆细胞和浆细胞,且反应强度比初次更强。浆细胞中内质网丰富,合成和分泌大量的抗体参与免疫应答。由B细胞介导的免疫称体液免疫。每个B细胞每小时约有1X107个抗体分子释放到细胞外,其分泌的Ig可高达其合成蛋白质总量的30%。 一般来说B细胞合成Ig后死亡,多余的B细胞则凋亡。B细胞凋亡不仅受基因调控,还受特异性受体信号控制。B细胞凋亡的敏感性与B细胞所处的环境及内在因素有关,提示多余B细胞的去处要涉及多种因素。每个受体的作用由其环境决定,并随B细胞发育阶段与凋亡触发因素的不同而异,同一受体的结合可产生不同效应。 免疫球蛋白分子结构 免疫球蛋白的基本结构是由二硫键连接的四条肽链组成的对称结构。分子量较小的一对肽链称为轻链(Light chain,L链),每条轻链约由214个氨基酸残基组成,L链共有两型,Kappa(κ)与Lambda(λ)。同一个免疫球蛋白单体分子上的L链型别完全相同。分子量较大的一对肽链称为重链(Heavy chain,H链),约由450~570个氨基酸残基组成。不同的重链由于氨基酸残基的排列顺序、二硫键的数目和位置、含糖的种类及数量不同,其抗原性也不同。根据H链抗原性的差异可将其分为5类:μ链、γ链、α链、δ链和ε链,每个Ig分子的两条重链亦完全相同。由上述不同类型H链与L链(κ、λ)组成的完整免疫球蛋白分子分别被称为IgM、IgG、IgA、IgD和IgE ?? 免疫球蛋白的两条轻链与两条重链由二硫键连接形成一个四肽链分子,构成免疫球蛋白分子的单体。 免疫球蛋白的其它成分 连结链(joining chain,J链) 是由浆细胞合成分泌的、分子量为20KD的多肽。通过J链可将Ig单体以二硫键形式共价结合到Ig重链上连接成多聚体,起到稳定Ig多聚体的作用 分泌片(secretory piece,sp) 是由粘膜上皮细胞合成的60~70KD多肽。当IgA与J链在浆细胞内合成并连接后,IgA双体在通过粘膜上皮细胞的过程中再与分泌片结合形成具有分泌能力的双聚体IgA,即分泌型IgA(secretory IgA)。分泌片的功能是保护IgA使之不易受环境中酶的破坏,并介导IgA的转运,但分泌片与IgA的合成无密切关系。 免疫球蛋白的水解片段 1、 用木瓜蛋白酶水解IgG,可将重链于链间二硫键近N端处切断,得到三个片段 每一个Fab段含有一条完整的轻链和重链N端的1/2部分,能与一个抗原决定簇发生特异性结合,即一个抗原结合价。Fab段是Ig具有抗体活性的部分,其结合抗原的部位在VL及VH功能区的超变区。Fc段在低温下容易结晶,由两条重链C端的一半组成,不能与抗原结合,但具有各类Ig的抗原决定簇及其它生物学活性。 2、 用胃蛋白酶水解Ig,可将IgG重链于链间二硫键近羧基端切断,得到一个具有双价抗体活性的片段,即 F(ab)2 段和若干小分子多肽碎片(pFc),后者无任何生物学功能。 膜型免疫球蛋白 B细胞表面也携带有Ig分子,B细胞表面的这种Ig称为膜表面免疫球蛋白(surface membrane immu
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