关于Penna模型的几个题目.pdfVIP

摘 要 Penna模型是基于无性繁殖的种群演化模拟模型，该模型于l995年由巴西 人T．J．P．Penna提出。Penna模型是以具有年龄结构的种群为研究对象的，该模 型除年龄外还考虑了环境压力、遗传因素、繁殖年龄、繁殖强度及突变等因素， 且随着分子生物学的进展，将相应的结果溶入到Penna模型中，使得Petma模型 有了很大发展。 Pemaa模型成功的主要原因之一是它采用了一种适合计算机处理的基于位串 的个体表示方法。使得人们可以在微机上进行较大规模的种群演化模拟。Penna 模型被广泛应用于研究种群动态的许多问题上，比如鲑鱼的灾难性死亡和阿拉斯 加狼群的发展等。 在Penna模型的发展和应用中，基本都延用了Peana模型的死亡机制，从而 对死亡率及各死亡原因的比例进行详细分析就是一个必要的工作。另外Penna模 型有一个很有趣的性质，就是共同祖先问题，对此本文也进行了讨论。本文结构 如下： 第一章中给出了Penna模型的简单介绍及其发展现状。 第二章中给出了研究单种群的数学模型和Penna模型的理论描述。Penna模 型的数学理论描述非常复杂，并且由理论得到的结果与实际模拟的结果存在很大 差异，这更体现了其作为模拟模型的优势。 在第三章中给出了Penna模型的几个问题，包括Perma模型的死亡率分析、 死亡原因分析以及共同祖先问题。并给出一些关于死亡率变化、主要死亡原因和 共同祖先存在性及性质的重要结论，包括：过量突变使疾病成为主要死亡原因； 任何情况下老死的个体几乎不存在以及只要种群不灭绝则共同祖先必然存在等 等。 最后对Penna模型仍可以继续深入研究的几个问题提出了看法。 关键词：Penna模型；Monte Carlo方法；种群；数学模型；死亡率；共同祖先 Abstract an iS ThePcnna is evolutionmodelbasedOilasexual model reproduction．and is farthemostsuccessful in bvT．j．P_Penna．It 1995 by comput撕onal published for comesfromthemutation model populations．Itsbiologicalsupport age-structured ofsenescence。 theory accumulation OnethereasonsthePennamodel’SSUCCESSreliesOila of for pattieularly means well—suited ofa ofa ofbhs， computational genomeby sequence representation the calabe on fast and operatedby bit-string．thesestrings efficiently very logical