SNP de novo分型中的数学题目.pdfVIP

SNP denovo分型中的数学问题 SNPde novo分型中的数学问题 摘 要 组学技术的快速发展为生物研究提供了基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等不 nucleotide 同层面的数据，为从系统水平上了解性状的遗传变异提供了基础。SNP(single 的应用于重要疾病相关联的基因筛选、不同物种遗传图谱的构建、动植物重要经济性 状的QTL定位、群体遗传结构和系统演化分析等。近几年来一系列基于高通量测序平 de 其是水生动物的SNPnovo规模开发和大样本群体遗传研究的有利途径。 由于大部分水生动物参照基因组缺乏，加上当前测序数据的序列很短只有大约30 novo分型相对于有参照基因组情况而言有以下的三个困难：(1) 到100bp，使得SNPde 数据量与获得SNP数目及SN