基因与环境的交互作用.ppt

* 南京医科大学流行病与卫生统计学系 单纯病例研究的logistic 回归 . logistic g e [fw=f] Logit estimates Number of obs = 176 LR chi2(1) = 4.54 Prob chi2 = 0.0331 Log likelihood = -114.66351 Pseudo R2 = 0.0194 ------------------------------------------------------------- g | Odds Ratio Std. Err. z P|z| [95% Conf. Interval] ----+-------------------------------------------------------- e | .4118016 .1800573 -2.03 0.042 .1747859 .970219 ------------------------------------------------------------- * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 交互作用的估计误差比较 病例对照研究中： 单纯病例研究中： * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 单纯病例设计和病例-对照设计检验效能比较 Pg =0.1, Rg=1,n=400 病例对照设计 单纯病例设计 Pe Ri Re=1 Re=2 Re=1 Re=2 0.2 1 0.000 0.000 0.042 0.036 2 0.037 0.072 0.511 0.615 4 0.450 0.480 0.999 0.999 6 0.742 0.747 1.000 1.000 8 0.877 0.877 1.000 1.000 10 0.936 0.921 1.000 1.000 0.4 1 0.000 0.000 0.037 0.038 2 0.120 0.169 0.645 0.620 4 0.604 0.589 1.000 1.000 6 0.850 0.794 1.000 1.000 8 0.930 0.891 1.000 1.000 10 0.960 0.941 1.000 1.000 * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 单纯病例设计和病例-对照设计样本含量比较 Re=2, Rg=1 RI=2, Pe=0.1(0.1)0.4 RI=4 , Pe=0.1(0.1)0.4 Pe 0.1 0.2 0.3 0.4 0.1 0.2 0.3 0.4 0.1 842 2677 498 1579 399 1259 366 1151 150 575 96 362 83 306 81 295 0.2 597 1705 360 1007 294 804 274 737 116 390 78 247 70 210 71 203 0.3 560 1455 343 862 284 690 268 634 115 349 80 223 74 191 77 186 0.4 590 1413 366 840 306 675 292 621 127 353 91 227 86 196 91 192 上行：单纯病例研究 下行：病例-对照研究 Power=80%, alpha=0.05, n1=n2 * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 单纯病例研究的应用 单纯病例研究比传统病例对照研究在估计交互作用方面更有优势：估计精度提高(同样检验效能等条件下，所需样本含量少)。 可以避免遗传背景不同所造成的选择性偏倚。 应用条件：基因型与暴露无关！ 局限性：只能估计交互作用,不能估计主效应。 不能校正协变量的效应。 * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 4 不完全病例-对照研究中G×E交互作用的估计 病例-对照研究中 病例组：暴露、基因信息比较容易获得 对照组：暴露信息容易获得 基因信息不易获得 在病例-对照研究中，当对照组缺乏基因信息时，称为不完全病例－对照研究(partial case-control study )。 * 南京医科大学流行病与卫生统计学系 不完全病例-对照研究(实例) G E 病例数 对照数 ＋ ＋ 25 a0 E+ a0 +c0 = 65 ＋ － 10 b0 E-