基于端粒G-四链体受体构建具有抗肿瘤药效团模型PPT.pptxVIP

基于端粒G．四链体受体构建具有抗肿瘤功效的药效团模型 演讲：XXX 目录 1 2 3 4 背景介绍 计算方法 结果与讨论 结论 01 / 背景介绍 G-四链体 02 / 计算方法 端粒G-四链体的受体配体复合物来源于文献的报道，为分子间的G-四链体四聚体结构，由4条富含鸟嘌呤的DNA单链构成。 其三维结构(PDBID：2JWQ)下载至Protein Date Bank(PDB)数据库。 软件采用美国Accelrys研发的专业生命科学分子模拟。 软件Discovery Studio 3．5中的Structure Based Pharmacophore模块。 二级标题 03 / 结果与讨论 3.1药效团模型的构建 首先进行受体配体复合物的导入，通过复合物的信息可以看到其共有2个结合口袋。分别用不同颜色标注活性口袋周围的残基。 蓝色表示活性位点l、绿色表示活性位点2，中间灰色球状物体为配体MMQ，灰红色相间的为另2条DNA链。 03 / 结果与讨论 3.1药效团模型的构建 在初次构建相互作用模型之后，20个以内药效团特征元素是一个比较合理的数目。 然后对药效团特征元素进行聚类分析后，Acceptor 12个、Donor 10个、Hydrophobe 8个。 去除离活性位点较远的药效团元素；根据选取的原子产生排除体积，最终得到一个