第一篇 蛋白质化学-2PPT.ppt

1.酶解法: 内切酶：胰蛋白酶、糜蛋白酶、 胃蛋白酶、嗜热菌蛋白酶 外切酶：羧肽酶和氨肽酶 (五) 多肽链的部分裂解 第三节????? 蛋白质的分子结构 三、蛋白质的一级结构 肽链 水解位点 ☆ 胰蛋白酶: R1=Lys和Arg，R2=Pro（抑制）; ☆ 糜蛋白酶/胰凝乳蛋白酶: R1=Phe、 Trp、Tyr等芳香族AA， R2为酸性：-/碱性：+； ☆ 嗜热菌蛋白酶：R2=Phe、 Trp、 Tyr、Leu、Ile、Met、Val及其它疏水性强的AA； ☆ 胃蛋白酶：专一性与糜蛋白酶类似，但要注两侧的残基都是疏水性氨基酸，pH=2; 第三节????? 蛋白质的分子结构 多肽链的部分裂解 ①溴化氰水解法(Cyanogen bromide) ——选择性地切割由Met羧基形成的肽键 多肽链的部分裂解 第三节????? 蛋白质的分子结构 ——较专一性断裂Asn-Gly之间的肽键，Asn-Leu及Asn-Ala键也能部分断裂 。 ②NH2OH断裂 多肽链的部分裂解 第三节????? 蛋白质的分子结构 1.Edman法 苯异硫氰酸酯法，是 Edman于1950年首先提出。 2.氨肽酶法或羧肽酶法 局限性较大，只能用来测定末端附近很少几个残基的序列。 3.质谱法（MS） 灵敏度高、所需样品少、测定速度快 第三节????? 蛋白质的分子结构 (六) 肽段氨基酸序列的测定 三、蛋白质的一级结构 PITC PTC-肽 蛋白质的二级结构指多肽链本身通过氢键沿一定方向盘绕、折叠而形成的构象。亦称高级结构。蛋白质的高级结构即蛋白质的构象问题。 天然蛋白质包括α-螺旋、 β-折叠、 β-转角、 无规则卷曲等二级结构。 第三节????? 蛋白质的分子结构 四、蛋白质的二级结构 ①肽链中的酰胺平面绕Cα相继旋转一定角度形成α-螺旋，并盘绕前进。每隔3.6个氨基酸残基，螺旋上升一圈；每圈间距0.54nm，即每个氨基酸残基沿螺旋中心轴上升0.15nm，旋转100°。 α-螺旋结构的主要特点： 第三节????? 蛋白质的分子结构 (一) α-螺旋(α-helix) 四、蛋白质的二级结构 ②螺旋体中所有氨基酸残基侧链都伸向外侧；肽链上所有的肽键都参与氢键的形成，链中的全部C=O和N-H几乎都平行于螺旋轴，氢键几乎平行于中心轴; (一) α-螺旋(α-helix) α-螺旋结构的主要特点： 第三节????? 蛋白质的分子结构 ③绝大多数天然蛋白质都是右手螺旋。每个氨基酸残基的N-H都与前面第四个残基C=O形成氢键。 (一) α-螺旋(α-helix) 第三节????? 蛋白质的分子结构 α-螺旋结构的主要特点： ①R基大小: 较大的难形成，如多聚Ile ； ②R基的电荷性质: 不带电荷易形成； ③当有Pro(吡咯环)的插入螺旋将会被中断，形成一个“结节”； a. C? -N /C -N不能旋转 b. 无法形成链内氢键 ④R为Gly时，使螺旋的稳定性大大降低。 (一) α-螺旋(α-helix) 第三节????? 蛋白质的分子结构 侧链在a-螺旋结构的影响： 第三节????? 蛋白质的分子结构 实例 胶原蛋白结构层次 胶原蛋白 第三节????? 蛋白质的分子结构 实例 毛发横切面和α-角蛋白的结构 α-角蛋白 微原纤维 初原纤维 α螺旋 第三节????? 蛋白质的分子结构 卷发(烫发)的生物化学基础 烫发时 还原剂 ?角蛋白在湿热条件下伸展转变为?—构象，冷却干燥时可自发地恢复原状。 实例 第三节????? 蛋白质的分子结构 卷发(烫发)的生物化学基础 实例 β-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，靠氢键联结而成的锯齿状片状结构。 第三节????? 蛋白质的分子结构 (二) ?-折叠(?-pleated sheet) ?-折叠结构的主要特点： 第三节????? 蛋白质的分子结构 (二) ?-折叠(?-pleated sheet) ①在? -折叠中，?-碳原子总是处于折叠线上，氨基酸的侧链都垂直于折叠片平面，交替地分布在片状平面的上面或下面，以避免R基团的空间障碍。 ②平行?片重复周期（重复距离）为0.65nm（0.7nm）。 0.7nm ?-折叠结构的主要特点： 第三节????? 蛋白质的分子结构 (二) ?-折叠(?-pleated sheet) ③维持β-折叠结构稳定性的力 —— 氢键。主要是由一条链上的羰基和另一条链上的氨基之间形成，即氢键是在链与链之间形