基因注释与功能分类哈医大《生物信息学基础》课件.pptVIP

第八章 基因注释与功能分类 第一节 引 言 第二节 基因注释数据库 (Gene Annotation Database) GO数据库最初收录的基因信息来源于3个模式生物数据库：果蝇、酵母和小鼠，随后相继收录了更多数据，其中包括国际上主要的植物，动物和微生物基因组数据库。 GO术语在多个合作数据库中的统一使用，促进了各类数据库对基因描述的一致性。 GO注释体系特点 GO通过控制注释词汇的层次结构使得研究人员能够从不同层面查询和使用基因注释信息。 从整体上来看GO注释系统是一个有向无环图(Directed Acyclic Graphs),包含三个分支,即: 生物学过程(biological process)，分子功能(molecular function)和细胞组分(cellular component)。 注释系统中每一个结点(Node)都是基因或蛋白的一种描述,结点之间保持严格的关系,即“is a”或“part of”。 1. 用关键词检索GO数据库 检索GO数据库通常先进入AmiGO的首页。在GO数据库中，每条记录都有一个数据标识号GO:XXXXXX和对应的术语。因此检索时需要知道待查基因的数字标识号或术语，将它们直接输入框中检索即可。如果检索的基因或蛋白质存在别名，可在检索框下勾“gene or proteins”,并在检索框中输入别名检索；“exact matc