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- 2018-06-21 发布于福建
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多种开发工具在医学图像处理课程教学中综合应用
多种开发工具在医学图像处理课程教学中综合应用
医学图像信息处理是一门结合了算法与程序设计的专业课程,若仅依靠Visual C++ 6.0作为开发平台,可能导致学生视野偏窄、学习效率偏低。通过此次教学改革,将Matlab、OpenCV、VTK及Visual Studio开发平台共同应用于教学过程中,在不同的章节突出不同的内容。实践表明,借助这些高级开发平台进行学习,学生学习积极性得到激发,理论水平及工程实践能力明显提升,为开展毕业设计或科研工作打下良好的基础。
1 引言
医学图像信息处理是结合温州医科大学医学特色,向信息管理与信息系统专业学生开设的一门高年级专业课,旨在让学生掌握生物医学成像及图像处理方面的基本原理、方法和发展趋势,拓宽学生知识基础,提高学生素质,使学生具有解决一般医学成像和图像处理问题的能力。
以前,在医学图像信息处理课程中是以Visual C++ 6.0和Matlab作为课堂演示及上机实验的平台。Visual C++ 6.0作为一种通用的开发平台,使用其编写程序时,工作量大,开发周期长。对于学生来说,把大量的时间用在熟悉开发语言而不是用在学习图像处理的算法上,显然不是本课程的目的。因此,仅使用Visual C++作为教学及实验的工具并不合适。
Matlab语法结构简单,提供了专门的图像处理工具箱,使学习者不必太多地去关心图像的文件格式、读写、显示等细节,而把精力集中在算法研究上。但是,仅偏重于学生如何使用Matlab工具箱实现图像处理的功能,不利于学生深入理解各种算法原理。而且,由于Matlab程序的移植性较差,学生学完后不能面对实际的开发应用,难以提高实践动手能力[1]。
本课题研究的目的在于拓宽学生知识面,在教学过程中增加了OpenCV和VTK这两种高层开发平台,以期提高学习效率,为开展学生科研、毕业设计以及今后的工作打下更加扎实全面的基础。
2 教学改革的具体实施
此项教学改革的总体思路是将Matlab、OpenCV、VTK共同引入医学图像信息处理课程的学习,在不同的章节嵌入适当的示例程序,分析算法原理和代码实现。同时,设计合适的实验项目,让学生能够按部就班、从简到难地开展基于以上开发工具的上机实??。改变学生由于C++语言的复杂繁琐所导致的学习积极性不高、缺乏自主探索意识的现状,转而能够在学习和实践中充分体验医学数字图像处理的内涵和魅力。同时,教师可以挑选对该方面感兴趣的学生,以学生科研课题或毕业设计的形式,做进一步的指导,从而使本课程的教学水平得到提高。
Matlab平台的应用 Matlab虽然不适合于本课程所有章节的演示与实验,但在介绍数字图像的一些基本概念时不失为一个好的平台,因为它具有界面直观明了、命令简单、易学易懂的优点。以下几幅图是在教学过程中使用的部分示例:图1是用Matlab命令显示的人体骨骼PET原始图像及其直方图,图2是原始图像的灰度反转图及其直方图。
OpenCV的应用 OpenCV即开源计算机视觉库,它是以C函数和C++类的形式实现大量图像处理算法。相对于Matlab而言,学生不仅可以利用OpenCV开放的源代码,以函数进行图像处理,而且可以查看算法的代码实现,在提高编程能力的同时理解算法的原理[2]。
在讲解图像增强、图像分割、图像变换时设计了采用Visual S+OpenCV为平台的实验内容。因为考虑到工具的高效性和通用性,所以OpenCV是本次教改中最为重要的一个教学内容,所占学时也最多。根据以往经验,大多数学生对OpenCV并不熟悉,配置OpenCV的开发环境又比较麻烦,仅让学生在实验课上跟着教师做一遍并不能让他们真正掌握知识,因此需要先在理论课上对OpenCV做详细的介绍,演示各种开发案例,讲解常用函数功能,然后在实验课上再让学生对照实验指导书安装OpenCV并一步步配置开发环境,接着完成各项实验内容,包括在win32控制台项目中使用OpenCV和在MFC框架下使用OpenCV进行数字图像处理。实验课后再布置若干个大型的实验任务,可以2~3人一个小组,让学生自己查资料开发完成,期末上交实验报告及源代码。
实践表明,采用理论课+实验课+课外实验的模式,整个学期持续地让学生接触、实践新的开发工具,才有可能比较好地掌握这个工具。否则,很可能就变成学一段忘一段的无效学习。图3是采用Sobel边缘检测算子分割图像的效果图,图4是对图像做阈值分割的效果图,图5和图6分别是对图像进行仿射变换和透视变换的效果图。
VTK的应用 VTK是在OpenGL的基础上,结合面向对象技术,重新设计和开发用于三维计算机图形、三维可视化、图像处理的C++类库。医学图像的三维重建和显示是本课程中最抽象的内容。在教学过程中,
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