w01-database数据库.pptxVIP

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  • 2018-06-21 发布于福建
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生物信息学数据库 核酸序列数据库 蛋白质序列数据库 基因组数据库 三维结构数据库 文献数据库 …… 三大核酸序列数据库 GenBank /genbank/ EMBL http://www.ebi.ac.uk/ena DDBJ http://www.ddbj.nig.ac.jp 特殊类型数据库 非编码RNA数据库(ncRNA) 表达序列标签数据库(dbEST) 序列标签位点数据库(dbSTS) microRNA数据库(miRBase) 环状RNA数据库(circBase) …… 基因表达数据库 基因表达库(GEO) 斯坦福微阵列数据库(SMD) ArrayExpress GXD CGED BodyMap 人类基因突变及疾病相关数据库 人类基因变异数据库(HMGD) 人类遗传双等位基因序列数据库(HGBASE) 人类孟德尔遗传在线(OMIM) 国际单体型计划(HapMap) 人类单核苷酸多态性数据库(dbSNP) 肿瘤基因数据库(TGDB) 人类表观遗传数据库(HEP) …… 蛋白质序列数据库 PIR:蛋白质信息资源, PIR提供三类序列搜索服务:基于文本的交互式检索;标准的序列相似性搜索,包括BLAST、FASTA等;结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索,包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。 Swiss-Prot:SWISS-PROT是经过注释的蛋

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