分子生物学201五年制万敏2015092301.ppt

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分子生物学201五年制万敏2015092301

总之,自然界DNA重组有同源重组、位点特异性重组和转座重组三类,位点特异性重组可以诱导DNA片段的整合、倒转或删除,转座重组是DNA片段在染色体中的移动。 * * * 咱们再看第二个特点;切割方式及末端特征! 这是ECORI 的识别序列,只能切割G-A中间的3’-5’磷酸二酯键,切开后我们发现,被限制酶切开的DNA带有几个伸出的核苷酸,他们之间正好互补配对,这样的切口叫黏性末端,简称黏端。也就是说,限制性核酸内切酶切割双链DNA分子后产生黏端。 * 还有一种情况,也有一些限制性内切酶比如smaI是在识别位点序列的中间切割,这样呢,产生了两条链具有平齐的末端,称作钝性末端(blunt end),简称钝端或平端。切割双链DNA分子后也可产生平端。 * 用图示的方法观察DNA连接酶的缝合作用! 这是ECORI 酶切后的片段,只有有互补的粘性末端才能结合,两个DNA片段通过碱基互补配对结合在一起。但是我们知道两个碱基之间氢键 结合力较弱。那么让后在用DNA链接酶连接双链DNA中的DNA单练缺口,形成3‘5’磷酸二指键.将两者DNA片段连接到一起。这个就是DNA连接酶的缝合作用。 * 既然是外切酶,从外部来切割DNA分子。3’?5’外切酶活性,就是沿着DNA3’?5’的方向从外部来切割DNA分子。比如,当DNA合成掺入不配对的碱基时,当掺入A碱基时,外切酶的活性将该碱基切除,在利用DNA聚合酶的活性加入Dctp. 由于该酶活能够沿着3’-5’方向切除不配对的碱基,重新合成DNA。所以具有纠错功能。 * * * * * * * * * * 2、常用克隆载体 (1)质粒(plasmid):最常用的克隆载体 广泛存在于细菌、酵母等多种微生物中 独立于宿主细胞染色体外,环状双链DNA(1~200 kb) 能在宿主细胞内独立自主复制 质粒的不相容性 在同一个细胞中,同类质粒不能并存的现象。 (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 质粒的不相容性 有相同复制起始区的不同质粒,不能稳定共存于同一宿主细胞。 (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (1)质粒(plasmid):最常用的克隆载体 ①pBR322质粒载体: A、含有一个复制原点ori B、5种常用内切酶的单一切点 C、两个筛选标志抗四环素基因(tet)和抗氨苄青霉素基因(amp)。 (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (1)质粒(plasmid):最常用的克隆载体 ② pUC18/19质粒载体: A、pBR322的复制起点(ori) B、Amp基因,但DNA序列发生变化,不再含原来限制性核酸内切识别位点 C、lacZ`基因替换Tcr基因 D、在lacZ`基因内部有一段MCS (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (1)质粒(plasmid):最常用的克隆载体 ③ TA克隆载体 A、PCR产物在Taq酶的非模板依赖活性作用下,于3`端加一非配对的A。 B、故可研制一种线性载体,其5`端各带一不配对T,可直接与PCR产物以TA连接进行克隆,即TA克隆。 (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (1)质粒(plasmid):最常用的克隆载体 A A dNTP T T dTTP Taq DNA聚合酶 载体 目的基因 TA TA (2)λ噬菌体克隆载体 λDNA (48.5kb) 噬菌体中:线性 宿主细胞:环状(cos位点) (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 cos cos 12bp 12bp 48500bp Nonessential portion for replication Long (left) arm Short (right) arm 非必需片段位于λDNA的中部,删除后并不影响噬菌体侵染大肠杆菌的能力。 λ噬菌体进行病毒包装时,要求λ DNA长度是野生型基因组的75%-105%。 (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (2)λ噬菌体克隆载体 cos位点:两端各有一条由12个碱基组成,彼此完全互补且5’突出的序列 插入型:λgt系列,可插入7Kb,适用于cDNA克隆 置换型:EMBL系列,可插入20Kb,适用于基因组DNA克隆 cos cos 12bp 12bp 48500bp Nonessential portion for replication Long (left) arm Short (right) arm (一)克隆载体用于外源DNA的克隆 2、常用克隆载体 (2)λ噬菌体克隆载体 ①黏粒(cosmid): 由λD

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