用Amp-FLP方法分析江浙沪汉族人群DIS80位点多态性 Analysis of DlS80 VNTR Polymorphism in Chine.pdfVIP

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用Amp-FLP方法分析江浙沪汉族人群DIS80位点多态性 Analysis of DlS80 VNTR Polymorphism in Chine

遗传 HEREDITAS(Beijing)18(4):15-181996 用Amp-FLP方法分析江浙沪汉族人群D1S80位点多态性 冯 哲 张雁征 杨 颖 张工梁 上(海血液中心,上海愉血研究所免疫遗传室,上海 200051) 陈仁彪 上(海第二医科大学医学遗传学教研室,上海 200025) 摘 要 采用PCR结合PAGE电泳及银染技术,即Amp-FLP方法,分析了148名江浙沪汉族人中 DIS80位点的多态性分布,观察到20种等位基因,53种基因型.首次在国际上发现重复单元数为39的 等位基因。该位点观察杂合性为0.86,个体鉴别力为0.96,多态性信息含量为0.83,基因频率分布符合 Hardy-Weinberg法则.本文结果提示,采用Amp-FLP技术分析D1S80位点多态性,样本分型具有较 高的准确性及灵敏度,适用于人类民族演变、法医学个体指认、亲子鉴定、遗传病基因连娜分析等研究 领域。 关键词 DIS80位点,Amp-FLP,VNTR AnalysisofD1S80Vle1TRPolymorphisminChineseHansinJiangsu, ZhejiangandShanghaiRegionsUsingAmp-FLPTechnique FengZhe ZhangYanzheng YangYing ZhangGongliang (ImmunogenetiesLaboratory,ShanghaiInstituteofBloodTransfusion,ShanghaiBloodCenter,Shanghai200051) Chen Renbiao (DepartmentofMedicalGenetics,ShanghaiSecondMedicalUniversity,Shanghai200025) 遗传学研究发现,人类基因组DNA的某些位点含有重复数目可变的非编码核心单元,称为可变数串连重复序 列(Variablenumberoftandemrepeats,VNTR).VNTR的高度多态性,可以为人类基因组DNA的识别提供重要 标记,适用于人类民族演变研究、法医学个体指认,亲子鉴定,遗传病基因连锁分析等方面.DIS80是以16bp为 核心单元的VNTR位点。Kasai首先用PCR方法证实D1S80位点的多态性 7().此后,Budowle等 1(991),、 Sajantila等1(992)(9)、孙光云等 1(994)cs〕分别在美国白人、芬兰白人、成都汉族人中对D1S80位点进行了研 究.本文使用扩增片段长度多态性a(mplifiedfragmentlengthpolymorphism,Amp-FLP),即PCR技术结合高分 辨率PAGE电泳及高灵敏度银染技术,分析了148名江浙沪地区汉族人D1S80位点的遗传多态性. 1材 料 和 方 法 1.1材料 1.1.1样本采集 采集148名父母祖籍均为江浙沪地区无血缘关系的汉族人外周静脉血,EDTA抗凝. 1.1.2DIS80特异性引物: 28bp5-GAAACTGGCCTCCAAACACTGCCCGCCG-3 29bp5-GTCTTGTTGGAGATGCACGTGCCCCTTGC-3 16 遗 传HEREDITAS(Beijing)1996 18卷 均由中国科学院上海植物生理研究所合成,Taq酶等试剂均购自华美生物工程公司,D1S80ladder购自Perkin Elmer公司。 1.2方法 1.2.1DNA抽提 采用经典酚一氯仿抽提法. 1.2.2PCR扩增 反应总体积50ul,含20ngDNA,1umol/L引物,200umol/LdNTP,2.5uTaq酶.PCR反 应条件:95C1分钟:65℃1分钟;721;1分钟,30次循环后72℃延伸10分钟。 1.2.3PAGE电泳 取6plPCR产物上样,使用D1S80ladder作指示,14V/cm,电泳5小时 l(o) 1.2.4银染 按Budowle等 1(991)方法略作改动 5(). 1.2.5统计分析

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