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蛋白质的结构和功能3
蛋白质三维结构特征 1、球状蛋白含有丰富的二级结构元件,而纤维状蛋白通常只含一种二级结构单元。 2、球状蛋白具有明显的折叠层次(一级?二级?超二级?结构域?三级、亚基?四级)。 3、分子呈现球状或椭球状。 4、疏水侧链埋藏在分子内部,亲水侧链暴露在外表 5、表面常常有空穴,配体结合部位(活性中心) 一、一级结构对蛋白质结构功能的影响 二、空间结构变化对蛋白质功能的影响 1、一级结构是空间构象的基础 2、同源蛋白质有顺序同源性 3、蛋白质的一级结构与分子病 4、前体与活性蛋白质一级结构的关系 蛋白质的空间构象的维持是靠次级键的作用,那么空间构象的改变也主要是次级键发生的变化,有的也是二硫键的变化。构象的改变与生物功能的丧失是蛋白质变性的核心。 蛋白质变性的种类: 1、可逆变性:当除去变性物质后,蛋白质的构象又可以恢复原状,生物功能也随之恢复的——复性。 2、不可逆变性:当除去变性因素时,蛋白质的构象不恢复原状,生物功能也不恢复。 同源蛋白质一级结构(序列)的特点: ① 同源蛋白质氨基酸序列具有明显的相似性(同源性)。 ② 有许多位置的氨基酸对所有种属来说都是相同的,称不变残基,不变残基高度保守,是必需的。 除不变残基以外,其它位置的氨基酸对不同的种属有很大变化,称可变残基,可变残基中,个别氨基酸的变化不影响蛋白质的功能。 ③ 多肽链长度相同或相近。 细胞色素C 分子量:12500左右 氨基酸残基:100个左右,单链。 25种生物中,细胞色素C的不变残基35个。 60种生物中,细胞色素C的不变残基27个。 亲源关系越近的,其细胞色素C的差异越小。 亲源关系越远的,其细胞色素C的差异越大。 人与黑猩猩 0 人与狗 10 人与猴 1 人与酵母 44 通过比较同源蛋白质的氨基酸序列的差异可以研究不同物种间的亲源关系和进化。 亲源关系越远,同源蛋白的氨基酸顺序差异就越大。 进化论有了分子水平上的直接证据。 蛋白质一级结构的突变导致分子病 分子病:由于基因突变导致机体合成蛋白质一级结构的改变,从而引起生物功能的障碍,而产生先天性疾病,这就是分子病。 最典型的例子是镰刀形贫血病 在正常人的血红蛋白β-链N末端第6位aa是Glu,而在镰刀形贫血病人中血红蛋白β-链N末端第6位aa是Val。 在血液中结合并转运O2 它由2a和2b四条多肽链构成,每个亚基都含有一个血红素分子,血红素中的二价铁原子在与氧结合的前后,并不发生价数的改变。 通过观察发现血红蛋白与氧的结合具有变构效应。 变构效应(allosteric effect):寡聚蛋白中由于一个亚基构象的改变,引起其它亚基构象与功能上的变化,叫变构效应。 (1)血红蛋白的结构 成人: HbA: a2b2 98% HbA2: a2d2 2% 胎儿: HbF a2g2 早期胚胎: z2 e2 四、寡聚蛋白的四级结构 (一)寡聚蛋白的概念 由多个亚基或亚单位(由两个分开的多肽链)聚合的蛋白质称为寡聚蛋白。由亚单位聚合而成的蛋白质分子。 亚基(Subunit),构成寡聚蛋白的具有完整的三级结构的多肽链(蛋白质亚单位)。亚基是一条或多条肽链,但肽链不一定是亚基。一个活性亚基也叫做一个单位(monomer),亚基一般是一条多肽链,但有的是多条多肽链,它们之间以二硫键相连。 四级结构(quaternary structure)所谓四级结构是指各个亚单位在寡聚蛋白中的空间排布和相互作用(不考虑亚单位的构象,因亚单位有它自己的特定的三级结构)。 构成蛋白四级结构的亚单位有的是相同的,有的是不同的。由相同亚单位构成的四级结构,叫均一四级结构(如酵母的乙醇脱氢酶,4个亚基)不同亚单位构成的四级结构,叫非均一四级结构。 ------------ 一、有关四级结构的一些概念 1、亚基与单体 2、单体蛋白质 3、原体(protomer) ☆有些对称的寡聚蛋白是由两个或多个不对称的等同结构成分组成,这种等同的结构成分称为原体。如血红蛋白α2β2就是由两个原体αβ组成。 有时也把原体称为单体。 (二)亚单位之间的聚合 寡聚蛋白的亚单位数目大多数是偶数的,血红蛋白是四个亚基,个别蛋白质是奇数亚基,如虫荧光素酶是三个相同亚基,有些亚单位,即是结构单位,又是一个功能单位,但只有聚合在一起时,才真正地起生物学功能。 蛋白质的四级结构是由什么力维持的呢?利用较弱的变性条件就可使寡聚蛋白的亚基分开,由此可见,维持蛋白质四级结构的力不是共价键,而是靠非共价结合的这些亚基为什么能
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