实用生物信息技术课程第4次作业BLAST数据库相似性搜索姓名______.docVIP

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  • 2018-06-30 发布于天津
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实用生物信息技术课程第4次作业BLAST数据库相似性搜索姓名______.doc

实用生物信息技术课程第4次作业BLAST数据库相似性搜索姓名______.doc

BLAST数据库相似性搜索 姓名________ 学号______________ 组号_____ 日期________年___月___日 以人血红蛋白beta亚基(HBB_HUMAN)为检测序列,搜索Swiss-Prot数据库,找出灵长目动物(Primates)中与HBB_HUMAN序列相似性高于90%(Identity90%)的beta珠蛋白(beta globin)。 以人血红蛋白alpha亚基(HBA_HUMAN)为检测序列,用BlastP搜索Swiss-Prot数据库,改变种子序列字长(Word size)和计分矩阵(Scoring matrix),找出人珠蛋白家族12个成员。 以人血红蛋白alpha亚基(HBA_HUMAN)为检测序列,用PSI-Blast搜索Swiss-Prot数据库,找出人珠蛋白家族成员脑红蛋白(Neuroglobin)。 以人血红蛋白alpha亚基(HBA_HUMAN)为检测序列,用DELTA-Blast搜索Swiss-Prot数据库,找出人珠蛋白家族成员脑红蛋白(Neuroglobin)。 以人血红蛋白alpha亚基(HBA_HUMAN)为检测序列,用tBlastN搜索RefSeq数据库中人珠蛋白家族mRNA序列,提取其编码区序列,进行多序列比对,分析结果。 以人血红蛋白alpha亚基(HBA_HUMAN)为检测序列,搜索RefSeq数据库中人

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