《化学信息学》读书笔记.docx

PAGE \* MERGEFORMAT1《化学信息学》读书笔记诺伯特·维纳对信息的著名定义：“信息就是信息，不是物质也不是能量。不承认这一点的唯物论，在今天就不能存在下去。”这句话深刻揭示了信息的重要地位，信息与物质、能量是客观世界的三大构成要素。信息：事物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。从产生信息的客体的性质来分，可分为自然信息（声、光、热、电、天气变化、地壳运动、天体演化等）、生物信息（如遗传信息、生物体内信息交流、动物种群内的信息交流）、机器信息（自动控制系统）和（人类）社会信息。以信息所依附的载体为依据，可分为文献信息、口头信息、电子信息、生物信息等。信息与知识和文献之间的区别信息（Information）：通过信号带来的消息。知识（knowledge）：人类社会实践经验的总结，是信息的一部分，需要通过信息使用归纳、演绎的方法得到。文献（document）：是用文字、图形、符号、声频、视频等技术手段记录人类知识的一种载体，或理解为固化在一定物质载体上的知识和信息。情报（information，intelligence）：激活了的知识。性质有知识性、传递性及效用性。经过传递的文献才是情报，资料是文献的通俗说法。化学信息概论化学信息学的产生和发展：信息：实物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。化学信息学：是应用信息学方法解决化学问题的学科。（化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。）化学信息学的研究领域：应用现代信息技术构建信息处理系统，处理长期积累的大量化学信息资源，帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据，正确地预测化学物质的性质，开发新化合物、材料和方法。应用计算机科学方法或信息学解决化学问题，对化学信息进行有效的存储、操作和处理，使化学信息合理地提升为化学知识。研究内容：化学、化工文献学；化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输；化学图形学；化学信息的解析与处理；化学知识的计算机推演；化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。信息资源检索的意义与作用：启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界，需要接受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。化学信息学的课程内容：化学信息的产生和获取：利用检索工具、通过实验方法 化学信息的表达、存储和管理：化学运筹学、数据整理可视化、数据库管理技术化学信息的加工和处理：化学计量学、化学软件、目的是获取更多的信息化学信息的深化：计算机模拟设计、化学结构的可视化以图形的方式对化学信息进行描述电子信息和数据库（一）电子信息：指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。联机信息资源，如：Dialog、STN、OCLC数据库光盘信息资源，包括单机版、网络版、联机版Internet网络信息资源（二）数据库：数据库是以特定方式合理地组织相互关联的数据集合。数据库的结构：（1）记录型文献数据结构 常用的字段：标题、作者、地址、期刊名、学科、文件类型、语种和摘要。记录的排序和索引：（1）顺排文档：按记录号顺序排列；（2）倒排文档：各个记录按照某一字段的值进行排列。信息检索的方法和步骤（一）信息检索的评价评价指标：查全率、查准率、漏检率、误检率、响应时间、用户负担、输出形式等。查全率和查准率：（1）查全率（R）：检索出的相关信息量（w）与该系统信息库中存储的相关信息量（x）的比率称为查全率，R=w/x ×100 %。（2）查准率（P）：检出的相关信息量（w）与检出信息总量（m）的比率称为查准率，P= w/m ×100 %。两者之间存在互逆关系，即查全率高时，查准率较低，反之亦然。（3）漏检率（O）：O = 1 – R = 1- w/x × 100 % 。（4）误检率（N）：N = 1 - P = 1-w/m × 100 % 。如果一个检索系统中与某一课题相关的信息共250条。检索操作后，实际检出了400条信息，其中相关信息为200条，此次检索效率可计算为： R = [200 /250] × 100 %=80% O = 1-80% = 20% P = [200/400] × 100%=50%