中国药科大学考研生物化学课件.doc

PAGE PAGE 14第三章 氨基酸(2学时)§3.1 氨基酸——蛋白质的构件分子§3.2 氨基酸的分类§3.3 氨基酸的酸碱化学§3.4 氨基酸的化学反应§3.5 氨基酸光学活性和光谱性质§3.6 氨基酸混合物的分析分离§3.1 氨基酸——蛋白质的构件分子一 蛋白质的水解二 α-氨基酸的一般结构氨基酸在中性pH时，以兼性离子形式存在。§3.2 氨基酸(amino acid)的分类—三种分类方法1 非极性氨基酸：9种，其结构如下2 极性不带电荷的氨基酸：6种3 带正电荷的氨基酸：3种4 带负电荷的氨基酸：2种5 几种不常见氨基酸的结构式根据R基团的结构或性质特点，巧记20种氨基酸的口诀甘、丙、缬、亮、异、脂链（脂肪链R基团的五种）丝、苏、半、蛋、羟硫添（含-OH，S者共四种）天、谷、精、赖、组、酸碱（酸性、碱性者五种）脯、酪、苯、色、杂芳环（芳杂环R基者四种）天冬酰胺、谷酰胺（两种酰胺）都有密码属“常见”（常见氨基酸都有特异的遗传密码）§3.3 氨基酸的酸碱化学1 氨基酸的两性解离性质：是电泳法、离子交换法分离氨基酸的基础氨基酸在晶体或水溶液中主要以兼性离子（zwitterion）形式存在。它在溶液中的带电荷情况，随溶液的pH的变化而不同。2 氨基酸的等电点在一定的pH条件下，氨基酸分子中所带正电荷和负电荷数相等，即净电荷为零，此时溶液的pH称为该种氨基酸的等电点（isoelectric point，pI）对侧链不解离的氨基酸 ：pI=(pKa1+pKa2)/2对于酸性氨基酸：pI=(pKa1+pKR)/2对于碱性氨基酸：pI=(pKa2+pKR)/2 ——可用酸碱滴定曲线来确定。例子：求Glu的等电点分析：pk值↓ ，越在较低的pH下解离离,∴α-羧基最先解离，α-氨基最后解离，根据pI的意义，就有:pI=（pKa1+pKR）/2=（2.19+4.25）/2=3.22 3 氨基酸的酸碱滴定曲线（甲醛滴定）由于氨基酸的等电点不是过高，就是过低，没有适当的指示剂可被选用。加入过量的甲醛，降低了氨基的碱性，当用NaOH滴定就使滴定终点的pH下降。通过滴定曲线求pI：每种氨基酸是在它的pKa值附近，而不是它的pI处发挥其缓冲作用。在等电状态下，氨基酸净电荷为零，且解离成阳离子§3.4 氨基酸的化学反应一 α-氨基参加的反应1 与亚硝酸的反应：是α-氨基所特有的反应，是Van Slyke氨基氮测定的基础。反应中放出的氮，一个来自HNO2，一个来自氨基酸。 2 与甲醛反应：甲醛滴定测定氨基酸含量及pKa3 与DNFB的反应：是Sanger用于测多肽氮端的基础多肽的N端的氨基酸残基与DNFB反应，可用来测多肽的N端氨基酸4 与PITC的反应：是Edmann降解测氮端氨基酸及多肽的序列测定的基础 PITC可用于多肽的序列测定 5 与DNS-Cl的反应：用于测多肽的N端氨基酸二 α-羧基参加的反应：1 成盐和成酯反应 ，2 成酰氯反应等三 α-氨基和α-羧基共同参加的反应：与茚三酮的反应——用于定性、定量测定氨基酸四 侧链R基的反应§3.5 氨基酸光学活性和光谱性质一 氨基酸的光学活性和立体化学1 20种标准氨基酸中，除Gly（R：H）外都具有旋光性。从蛋白质温和水解得到的氨基酸都是L-型。2 Thr、Ile除α-C是不对称碳原子外，还有第二个C*，有四个异构体二 氨基酸的光谱性质§3.6 氨基酸混合物的分析分离一 薄层层析：薄层层析是分配层析的一种。进行定性和定量测定。二 离子交换层析是分离、分析氨基酸的有效方法选择一定的pH和离子强度的缓冲溶液进行洗脱，不同氨基酸和树脂的结合能力不同，在洗脱过程中将依次被从柱子上洗出，而达到分离的目的。三 氨基酸的电泳分离电泳（electrophoresis）是指带电质点在电场中的移动。移动速率（μ）∝Q/r。式中Q是指质点所带的净电荷，可用（pI-pH）的差异表示，r是质点的半径。例子：Lys、His、Leu、Glu在pH6.0的缓冲溶液中进行电泳，结果如图，请指出各氨基酸在图中的位置。第四章 蛋白质(4学时)第一节 蛋白质通论一 蛋白质的化学组成和分类 二 蛋白质分子的形状及大小三 蛋白质的构象和蛋白质结构的组织层次 四 蛋白质功能的多样性一 蛋白质的化学组成和分类1 蛋白质的组成蛋白质的元素组成：蛋白质由C、H、O、N、S等元素组成。有些蛋白质还含有其它一些元素，如P、Fe、Cu、I、Zn和Mo等。其中N在蛋白质中的平均含量为16%，是蛋白质元素组成的一个特点，也是凯氏定氮法测定蛋白质含量的计算基础：蛋白质含量=蛋白氮×6.25蛋白质的化学组成：单纯蛋白质仅由氨基酸构成；但缀合蛋白质还有其它成分。2 蛋白质的分类 ② 根据蛋白质的溶解度分：见P158表4-1