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- 2018-07-09 发布于江苏
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正确理解定量蛋白质组学6
正确理解定量蛋白质组学上期分享的蛋白组学内容,是不是有些小伙伴还绕在云里雾里呀?这次,小编用实例说话,帮您梳理清楚。Label-free定量Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化,通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数(Spectra Count,简称SC)和基于肽段母离子强度(或色谱离子流的峰面积即XIC)两种方法,后者更准确,使用更广泛。技术特点无需标记,操作简单;不受比较样品数限制;对实验操作稳定性、重复性要求高;准确性较标记定量差;要求至少做三次技术重复或生物重复。适用范围适合大样本量的定量比较;对无法用标记定量实现的实验设计,易用label-free技术;经典案例题目:Label-free global serum proteomic profiling reveals novel celecoxib-modulated proteins in familial adenomatous polyposis patients(利用Label-free定量技术进行家族性腺瘤息肉病患者血清的全蛋白质组分析,寻找Celecoxib调控蛋白)期刊:Cancer genomics proteomics主要技术:La
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