高性能计算-第二次课.ppt

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高性能计算-第二次课

如果每个进程都阻塞在MPI_Send上,则没有进程回去调用MPI_Recv ,此时程序就会发生死锁。 每个进程都在等待一个不会发生的事件发生。 依赖于MPI提供的缓冲机制是不安全的。 这样的程序在运行一些输入集时没有问题,但有可能在运行其他输入集时导致崩溃或者挂起。 High-performance Computing Applications 引出几个问题! 怎么才能说一个程序时安全的? 怎样修改并行奇偶交换排序程序中的通信过程,使其安全? High-performance Computing Applications MPI_Ssend MPI标准提供的一个函数来替代MPI_Send。 这个额外的字母“s”代表同步,保证了直到对应的接收开始前,发送端一直阻塞。 High-performance Computing Applications 重构通信 High-performance Computing Applications MPI_Sendrecv MPI提供的自己调度的方法。 他会分别执行一次阻塞式消息发送和一次消息接收。 dest 和source 参数可以不同也可以相同。 优点在于,MPI库实现了通信调度,使程序不再挂起或崩溃。 High-performance Computing Applications MPI_Sendrecv High-performance Computing Applications 5个进程之间的安全通信 High-performance Computing Applications 并行奇偶排序算法中的Merge_low函数 只记录前4个 并行奇偶排序算法的运行时间 (times are in milliseconds) High-performance Computing Applications 本章小结 消息传递接口(MPI):是一个可以被C, C++和Fortran程序调用的函数库。 通信子:一组进程的集合,该集合中的进程之间可以相互发送消息。 单程序多数据流(SPMD):许多并行程序通过根据不同的进程号转移到不同的分支语句。 High-performance Computing Applications 大多数串行程序时确定性的:若用同一个程序运行相同的数据得到的结果是一样的。 大多数并行程序时非确定性的:同样的输入会得到不同的输出。 集合通信:不同于只涉及两个进程的MPI_Send和MPI_Recv,它涉及一个通信子中的所有进程。 High-performance Computing Applications 墙上时钟时间:即运行一段代码所需要的时间,它包括用户级代码,库函数,用户代码调用系统函数的运行时间以及空闲时间。 加速比:串行运行时间与并行运行时间之比。 效率:加速比除以进程总数。. High-performance Computing Applications 可扩展的:如果增加问题的规模(n),随着p的增加,效率却没有递减,则称该并行程序时可扩展的。 不安全的:MPI_Send既可以阻塞也可以缓冲输入。 High-performance Computing Applications The University of Adelaide, School of Computer Science * Chapter 2 — Instructions: Language of the Computer * The University of Adelaide, School of Computer Science * Chapter 2 — Instructions: Language of the Computer * * * MPI_Type create_struct 由这个函数创建由不同基本数据类型的元素所组成的派生数据类型: High-performance Computing Applications MPI_Get_address 它返回的location_p是所指向的内存单元的地址。 这个特殊类型的MPI_Aint是整数型,它的长度足以表示系统地址。 High-performance Computing Applications MPI_Type_commit MPI_Type_commit 存储的是元素的MPI数据类型。它允许MPI实现为了在通信函数内使用这一数据类型,优化数据类型的内部表示。 High-performance Computing Applications MPI_Type_free 当我们使用新的数据类型时,可以用MPI_Type_free 函数去释放额外的存储空间。 High-perform

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