组会 NAC_附件.pptVIP

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  • 2018-07-17 发布于湖北
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NAC的结构特征 目前NAC转录因子结构模型中, 典型模型是N端存在一个高度保守的NAC结构域, C端是变化多样的转录调控域。 NAC结构域:一般由约150个氨基酸组成,分为5个亚结构域A~E。 NAC的转录调控区域:位于高度分散的C端,激活或抑制转录,有几组重复的富含丝氨酸-苏氨酸、脯氨酸-谷氨酸或酸性氨基酸残基的特异基序,这些基序对NAC同一亚家族是保守的,在不同的亚家族之间却有差异,可能赋予了NAC蛋白质特异的功能变化。 NAC的分类 通过比较NAC结构域的氨基酸序列,可将NAC分为两组:Ⅰ组和Ⅱ组.这两个组在NAC结构域保守性方面存在差别。此外,根据NAC结构域结构上的 相似性可将每个组的NAC结构域分为多个亚组。其中Ⅰ组 可分为14个亚组,Ⅱ组可分为4个亚组。 NAC的亚细胞定位分析 亚细胞定位是指某种蛋白或表达产物在细胞内的具体存在部位。 亚细胞定位预测的 常用方法 NAC的转录激活作用分析 NAC转录激活活性通常在酵母细胞中进行检测。常用方法是构建转录激活表达载体,转化至酵母菌中,在营养缺陷型培养基上培养,能够生长的酵母菌具有转录激活活性,通过 β-半乳糖苷酶染色可进一步确定转录因子的转录激活作用。 常用的载体有 pGBKT7、pDBLeu 等。 NAC的功能预测 通过生物信息学方法对NAC转录因子进行分析可以对其功能进行预测。通过系统进化树分析,将结构相近的NAC转录因子聚类, 进一步分析聚类在一起的NAC亚家族成员的C端基序,发现在同一亚族里的NAC转录因子具有相同的基序, 不同亚族里的NAC转录因子具有不同的基序, 所以结合已知功能的NAC转录因子, 可以推测在同一亚族里其他成员的功能. 但是虽然系统进化分析可以对NAC转录因子进行分类,并可以通过结合特异的基序对其进行功能预测, 但是明确的功能还需结合表达特性分析、转基因过表达等实验来验证。 拟南芥中转录因子数量如此之大,种类之多,表明了高等植物转录调控的复杂性,同时也表明转录因子研究的重要性 首次报道了NAC转录因子的结构域, N 激活或抑制转录,有几组重复的富含丝氨酸-苏氨酸、脯氨酸-谷氨酸或酸性氨基酸残基的特异基序,这些基序对NAC同一亚家族是保守的,在不同的亚家族之间却有差异,可能赋予了NAC蛋白质特异的功能变化。 水稻和拟南芥中的NAC结构域在两个组中都有分布,但所有已鉴定的的NAC家族蛋白都属于group1. nac划分为两大组,18亚组 真核生物转录过程主要发生在细胞核中,因而转录因子一般定位在细胞核中 所述SlSRN1蛋白质含有N-末端的典型的NAC域和跨膜序在C端(图1A),并显示同一性的最高水平,以NbNPT2和马铃薯StNTP2 [42]和拟南芥ANAC017 [77],ANAC016〔 78]和ANAC013 [58]。跨膜序和序列同一性高的水平以最近功能特征的NAC蛋白的存在表明,SlSRN1属于膜结合转录因子[81]。该ANAC017,NbNTP2和StNPT2示靶向内质网膜[42,77]。同样,我们也观察到SlSRN1被靶向时瞬时表达在洋葱表皮细胞质膜(图2A)。在我们的研究中,SlSRN1具有在酵母细胞中转录活性(图2B),这表明SlSRN1是一种转录激活剂。 SlPAPA1转录激活作用分析载体构建图;b)pGBKT7及pGBKT7-SlPAPA1转化酵母后在全营养YPDA、单缺SD和三缺SD培养基上的生长状况及三缺SD培养基β-半乳糖苷酶染色照片,其中转化pGBKT7的酵母作为负对照 与非生物胁迫相关的转录因子——NAC 汇报人:李倩倩 与非生物胁迫相关的转录因子 1 1 与非生物胁迫相关的转录因子 2 NAC的发现 3 NAC的结构特征 4 NAC的分类 5 亚细胞定位分析 6 转录激活作用 7 功能预测 转录因子(transcription factor, TF) 转录因子也称为反式作用因子,主要以同源或异源二聚体的形式同顺式作用因子发生特异性的结合,通过和某些辅助调控子发生作用而影响转录复合体的形成,从而调节植物基因的特异性表达。 目前在拟南芥基因组中共鉴定到1533个转录因子,分属于37个不同家族。 参与植物非生物胁迫相关的转录因子 NAC转录因子是植物特有的一类转录因子.其数量众多,广泛分布于陆生植物中.在植物中发挥着不可低估的作用 与非生物胁迫相关的植物转录因子的代表 1 与非生物胁迫相关的植物转录因子 MYB WRKY MYC DREB NAC 目前,在许多植物中都发现了成员众多的含NAC 结构域的 NAC 家族转录因子。 拟南芥 水稻 葡萄 白杨 大豆和烟草 152 1

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