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r绘制中国地图 并展示流行病学数据_光环大数据培训机构
光环大数据--大数据培训人工智能培训
R 绘制中国地图 并展示流行病学数据_光环大数据培训机构
流行病学的数据讲究“三间分布”,即人群分布、时间分布和空间分布。其
中的“空间分布”最好是在地图上展示,才比较清楚。R 软件集统计分析与高级
绘图于大成,是最适合做这项工作了。关于地图的绘制过程,谢益辉、邱怡轩和
陈丽云等人都早有文章讲述,开R 地图中文教程之先河。由于目前指导毕业论文
用到,因此研究了一下。本来因为网上教程很多,曾打消了写些文字的计划,但
怡轩版主鼓励说“教程者众,整合者鲜”,所以才战胜拖延症,提起拙笔综述整
合一下,并对DIY 统计GIS 地图提出了一点自己的想法。
1 地图GIS 数据的来源与R 绘制软件包
中国地图 GIS 数据的官方数据可以在国家基础地理信息中心的网站
()里面可以免费下载。官方公开的数据包括:地图
数据,及居住地、交通、河流等辅助数据。今年6 月开始,官方正组织开始制作
新版数据。老数据暂时无法下载,读者要自行百度搜索,本文以旧版数据为例。
旧版地图数据中部分地名和地市区划已经过时,使用时需注意。
地图数据有 4 个压缩文件:bou1_4m.zip、bou2_4m.zip、bou3_4m.zip 和
bou4_4m.zip。bou 代表边界的意思,数字 1~4 代表国家、省、市、县的4 级行
政划分;4m 代表比例是 400 万分之一,这个比例的图形是公开的。每个文件解
压缩后含有两类文件:以字母p 结尾的表示多边形数据,用来绘制区域;以字母
l 结尾的文件是线形数据,用来绘制边界。但是老版数据中,市级数据中缺少绘
制区域的多边形数据,让市级分布图的绘制稍麻烦一些,新版中也许会有改进。
用R 绘制地图比较简单。比如画一下全国范围的区域,可以用如下代码:
library(maptools)mydat =
光环大数据
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readShapePoly(maps/bou1/bou1_4p.shp)plot(mydat)
但是,可以看出这样绘制的地图的形状有些扁平。这是因为,在绘图的过程
中,默认把经度和纬度作为普通数据,均匀平等对待,绘制在笛卡尔坐标系上造
成的。其实,地球的球面图形如何映射到平面图上,在地理学上是有一系列不同
的专业算法的。地图不应该画在普通的笛卡尔坐标系上,而是要画在地理学专业
的坐标系上。在这一点上,R 的ggplot2 包提供了专门的coord_map()函数。所
以推荐R 的ggplot2 包来绘制地图。
library(ggplot2)mymap = ggplot(data = fortify(mydat)) +
fill = NA) + theme_grey()print(mymap + coord_map())
这次中国地图的形状与百度地图一样了。
ggplot2包的coord_map 函数默认的映射类型是mercator。如果有其他需要,
可以使用其他的映射类型来绘制地图,如:
mymap + coord_map(projection = azequidistant)
coord_map 函数的映射类型及其含义可以通过下列代码查询帮助,一般我们
用默认的就可以。
library(mapproj)?mapproject
光环大数据
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2 GIS 地图的数据结构及省市地图的绘制
GIS 地图有很多种存储格式,其中 shapefile 格式(.shp)可以通过R 的
maptools 包打开。其他格式可以去R 官网查询相应的软件包。
地图数据基本可以分为点、线、面三种数据,在maptools 包内分别有对应
的函数来读取(readShapePoints、readShapeLines 和 readShap
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