基因注释与功能分类哈医大《生物信息学基础》ppt课件.pptVIP

第八章 基因注释与功能分类;第一节 引 言;第二节 基因注释数据库 ;一、基因本体（Gene Ontology, GO）数据库;GO数据库最初收录的基因信息来源于3个模式生物数据库：果蝇、酵母和小鼠，随后相继收录了更多数据，其中包括国际上主要的植物，动物和微生物基因组数据库。 GO术语在多个合作数据库中的统一使用，促进了各类数据库对基因描述的一致性。 ;人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用《生物信息学》;GO注释体系特点;1. 用关键词检索GO数据库 检索GO数据库通常先进入AmiGO的首页。在GO数据库中，每条记录都有一个数据标识号GO:XXXXXX和对应的术语。因此检索时需要知道待查基因的数字标识号或术语，将它们直接输入框中检索即可。如果检索的基因或蛋白质存在别名，可在检索框下勾“gene or proteins”,并在检索框中输入别名检索；“exact match”表示是否完全匹配，可供选择。;这里以检索神经源性分化因子6（NEUROD6）为例。在检索框中输入“NEUROD6”并勾选“gene and proteins”和“exact match”,运行后所得基因产物检索结果如图所示。;此图显示了该基因产物的基本信息，包括类型、物种、别名来源和序列 ;此图显示了该基因产物的术语关联（Term Associations）图，图中记录名称“Term”是GO记录的名