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- 2018-08-06 发布于贵州
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叶俏血浆循环DNA在原发性干燥综合征和系统性红斑狼疮中的意义ppt课件
血浆循环DNA在原发性干燥综合征和系统性红斑狼疮中的意义
嘉兴市第二医院
风湿免疫科
叶俏
背景
血浆循环DNA,它具有DNA双螺旋结构,与基因组的DNA核苷酸及碱基组成上基本一致,能代表生物学特性,在肿瘤上研究很多,在免疫性疾病中报道不多,尤其在干燥综合症中报道甚少。
测定pSS、SLE血浆cDNA浓度值,旨在探讨cDNA在pSS及SLE中的意义。
对象和方法
pSS患者 36例均符合2002年干燥综合征国际分类标准
SLE患者(排除继发干燥综合征患者)共29例,诊断符合美国风湿病学会(ACR)1982推荐的SLE分类标准
健康体检者30例
排除感染、肝炎、结核、创伤、应激、严重的心血管及脑血管疾病急性期等可致cDNA升高的因素。
主要试剂和仪器
微量样品DNA提取试剂盒(购自天根生化科技有限公司)
LightCycler 480(Roche Diagnostics)实时定量仪
日立7060/70C70型生化仪(日本)。
观察指标
血浆cDNA
血沉(ESR),C-反应蛋白(CRP),免疫球蛋白(IgA、IgG、IgM)
SLEDAI,SSDAI,SSDDI
标本采集
取静脉血5ml置于EDTA抗凝管中 ,离心完全去除血细胞成分置干燥洁净冻存管中,
-70°C低温冰箱保存备检,统一检测 。
血清DNA的扩增
PCR扩增管家基因GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)
genbank:NM_001256799.1
引物序列:Primer Forward:5-CTGGGCTACACTGAGCACC-3,Primer Reverse:5-AAGTGGTCGTTGAGGGCAATG-3 ,PCR产物长度186dp
血清DNA的扩增
扩增反应采用三步法PCR扩增标准程序:50 循环数, 第一步-预变性:95℃ 30秒 ,第二步-PCR反应:(50个循环) 95℃ 5秒, 55℃ 30秒,72℃ 30秒 。
标准品的制备
利用正常人血浆提取质粒,并检测质粒OD(吸光度)值,通过所得OD值计算核酸质量,利用跨内含子的基因GADPH的引物扩增样品,测得样品血清中核酸的具体含量,并对质粒进行10倍的梯度稀释,得到浓度相差10倍的一系列标准品备用
标准品的制备
利用各标准品扩增所得CT值与相应标准品浓度,得到样品模板量计算公式为:X=(Y-28.69235)/-3.62966(Y:Ct值,X:模板量),根据这个公式计算标本循环DNA含量
统计学处理
采用SPSS18.0 软件对资料进行统计学分析,定性资料的比较采用χ2检验,定量资料表示, 各组间比较采用单因素方差分析,相关分析定量资料采用Pearson相关分析;等级资料采用Spearman相关分析,P0.05表示差异有统计学意义 。
结 果
3组血浆循环DNA统计所得结果柱状图见图(纵坐标单位为ng/ml)
各组间cDNA值比较
组别
浓度值
pSS组(n=36)
368.24±196.68ab
SLE组(n=29)
244.51±164.10b
对照组(n=30)
24.56±16.76
注:3组两两比较:与SLE组比较aP0.05;与对照组比较bP0.05
表1 3组循环DNA浓度值(ng/ml)比较
pSS组各指标间的相关性分析
cDNA
SSDAI
SSDDI
ESR
CRP
IgA
IgG
IgM
浓度值
0.551**
0.198
-0.089
-0.252
-0.246
0.333*
-0.086
(0.01)
(0.248)
(0.605)
(0.137)
(0.148)
(0.047)
(0.617)
表2 循环DNA浓度值与SSDAI,SSDDI等指标的相关性分析(r, n=36)
注:表内为相关系数r, 括号内为P值, *P0.05, **P0.01。
pSS组cDNA与SSDAI相关性分析
pSS组cDNA与IgG相关性分析
SLE组各指标间的相关性分析
cDNA浓度值与SLEDAI、ESR、CRP、免疫球蛋白等指标无相关性 .
讨 论
循环DNA,又称为游离DNA,正常人血浆/血清中存在微量游离DNA,来源于各条染色体的片段数与该染色体的大小有关 ,片段中内含子、外显子、插入序列的比例与全基因组构成比相似,因此循环DNA与疾病密切相关。
Suzuki N,Kamataki A,Yamaki J,el a1.Characterization of circulating DNA in healthy human plasma[J].Clin Chim Acta,2008,387;55- 58
讨论
在pSS, SLE中循环DNA的升高,与对照组比均有显著差异(P0.05)循
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