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基因组学与医学 Genomics and Medicine;第　一　节;一、基因组学概念及范畴;1. 病毒基因组;噬菌体phiX174;乙型肝炎病毒（HBV）;乙型肝炎病毒基因组;.;人类免疫缺陷病毒(HIV) （human Immunodeficiency virus ） ;2. 原核生物基因组;类核（nucleoid）：细菌染色体在  细胞内形成的一个致密区域;由一条环状双链DNA分子组成，  通常只有一个DNA复制起点。; 质粒DNA;3. 真核生物基因组;1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12;人类线粒体基因组;基因组学(genomics) 就是发展和应用DNA制图、测序新技术以及计算机程序，分析生命体（包括人类）全部基因组结构及功能。;基因组学包括3个不同的亚领域;二、结构基因组学;人类基因组计划：;Initial sequencing and analysis of the human genome;The Sequence of the Human Genome;人类染色体DNA大小;（一）物理制图 （二）遗传制图 （三）基因组DNA序列测定 （四）创建计算机分析管理系统 ;绘制物理图谱（physical map）： 利用已知序列的DNA片段为基因组分区，位点距离用bp表示。 作图标志称为序列标志位点（sequence tagged sites,STSs）。;克隆载体： Cosmid（粘粒） YAC（酵母人工染色体） BAC（细菌人工染色体）;Y号;绘制遗传图谱（genetic map）： 利用人类基因组中自然存在的一些特殊位点作为遗传标志，确定标志位点在一条染色体DNA上的线性排列顺序，标志位点间的距离用cM表示?。;遗传标志： RFLP（限制性片段长度多态性） VNTR（可变数目串联重复序列） STR（短串联重复序列） SNP（单核苷酸多态性）;A;;Chromosome;（三）基因组DNA序列测定;DNA测序基本步骤;DNA;大肠杆菌 (Escherichia coli) 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 拟南芥(Arabidopsis thaliana) 秀丽小杆线虫 (Caenorhabditis elegans) 果蝇 (Drosophila melanogaster) 小鼠 (Mus musculus);（四）创建计算机分析管理系统 主要的人类基因组数据库;;;;HGP主要任务及内容; 通过HGP获得的广泛基因组信息组成了结构基因组学的基本内容，是开展功能基因组学的研究的基础； 同时为详尽研究每一个单基因遗传病提供“平台”，并将成为复杂的多基因遗传病研究的发端。;; 完成一个生??体全部基因组测序后即进入后基因组测序阶段——详尽分析序列，描述基因组所有基因的功能，包括研究基因的表达及其调控模式，这就是功能基因组学。 ;（一）鉴定DNA序列中的基因 （二）同源搜索设计基因功能 （三）实验性设计基因功能 （四）描述基因表达模式 ;（一）鉴定DNA序列中的基因; ;;;;（三）实验性设计基因功能;（四）描述基因表达模式;转录组学的研究方法－DNA芯片技术;蛋白质组(proteom)： 一个细胞内的全套蛋白质，反映了特殊阶段、环境、状态下细胞或组织在翻译水平的蛋白质的表达谱。 这一研究领域叫蛋白质组学(proteomics)。;双向电泳（two dimension electrophoresis,2-DE）： 蛋白质具有等电点和分子量的特异性，将蛋白质混合物在电荷（等电聚焦，IEF）和分子量（变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，SDS）两个水平上进行分离。;;Moleculars;功能基因组学研究策略及主要内容;四、比较基因组学;进化树（系统发生树）; “微型人” 生理系统与人非常相似 90%的基因与人类同源; ;;The Relation between Genomics and Medicine;? 医学相关问题 ;疾病的分子机制：病原,病理和预后， 疾病的易感性， 遗传与环境的影响。;分子诊断：疾病的预测,药物耐受性， 疾病的分型。;分子治疗：药物靶, 基因治疗;一、基因病的概念;二、疾病相关基因的鉴定;（一）检测人类基因变异或突变;等位型1;寡核苷酸杂交分析SNP