13计算表观遗传学.ppt

第一节 引言 一、 表观遗传学与计算表观遗传学 二、 计算表观遗传学的研究内容 三、 计算表观遗传学的方法和工具 四、 计算表观遗传学的进展 第二节 基因组的DNA甲基化 一、CpG岛的DNA甲基化调控基因的表达 （一） DNA甲基化与CpG岛 （二） 甲基化对转录的调控 （三） DNA甲基化的意义 （一） DNA甲基化与CpG岛 DNA甲基化是一种发生在DNA序列上的化学修饰，可以被稳定地在转录及细胞分裂前后遗传。DNA甲基化是重要的表观遗传代码。 DNA甲基化 在哺乳动物中，大约60%-90%的CpG二核苷酸是甲基化的。CpG中的p代表连接脱氧胞嘧啶核苷和脱氧鸟嘌呤核苷的磷酸基团。 在哺乳动物细胞中，DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸中胞嘧啶的第五位碳原子上，这样的胞嘧啶也叫做5-甲基-胞嘧啶，如图所示。 CpG岛与DNA甲基化的关系 CpG二核苷酸倾向于聚集成簇，这样的区域称做CpG岛（CpG islands）。 CpG岛的特点是GC的含量及CpG的含量非常高。 CpG岛主要分布在基因的5’非编码区，启动子和第一外显子区域，大约80%的基因的启动子含有CpG岛。这些区域的CpG二核苷酸的富集表明它们处于非甲基化状态（至少在生殖细胞中），因此避免甲基化CpG带来高的突变率。 （二） 甲基化对转录的调控 DNA甲基化影响转录的机制 1. DNA甲基化阻碍转录