《中国黄牛亲缘关系分析》.docVIP

综合实验：中国黄牛mtDNA cytb基因进化分析 PAGE PAGE 2 中国黄牛mtDNA cyt b基因进化分析 报告题目 中国黄牛mtDNA cyt b基因进化分析 作者姓名 占晶 班级学号 0802/41 指导教师 张润锋 完成时间 2010年12月 生物学实验教学中心 目 录 TOC \o 1-3 \u 引言 PAGEREF _Toc \h 1 1 实验材料 4 2 实验方法 4 2.1血样采集和DNA样品制备 5 2.2 PCR引物 6 2.3 PCR反应和PCR产物检测 7 2.4 PCR产物回收测序 8 2.5数据分析与结果处理 8 3 结果与分析 10 3.1中国黄牛基因组DNA提取结果。 10 3.2中国黄牛mtDNA cytB基因PCR扩增结果。 11 3.3 中国黄牛mtDNA cytB基因序列分析结果。 16 3.4 中国黄牛mtDNA cytB分子进化分析，进化树的构建。 17 总结 18 参考文献 18 中国黄牛mtDNA cyt b基因分子进化分析 占晶 （指导老师：张润锋） （湖北师范学院生命科学学院 生物科学0802班 湖北 黄石 ） 摘 要：利用分子生物学方法，结合生物信息学技术，利用线粒体基因序列分析中国黄牛的亲缘关系及起源进化。中国家牛多元说虽然在国内外得到公认，然而黄牛品种也同样面临着遗传资源的保护问题，因此，尽快从分子水平对我国固有黄牛品种的亲缘关系及起源进化进行研究十分重要。测定了秦岭以北秦川牛、渤海黑牛、蒙古牛、鲁西牛以及秦岭以南宣汉牛、闽南牛、南阳牛七个品种牛与V00654牛线粒体DNA细胞色素b基因片段，其中18个位点检出变异，分析其碱基组成和变异情况，并以V00654牛为标准，应用DnaSP Version 3.5软件[214]分析所有序列的变异 (多态) 位点、应用MEGA version 4.1软件计算品种内和品种之间基于Kimura’s two-parameter的平均遗传距离和应用MEGA version 4.1软件构建所有单倍型基于Kimura’s two-parameter的平均遗传距离的NJ以及UPGMA 分子系统进化树，在分子水平从母系遗传的角度澄清7个黄牛品种的起源分化关系。结果显示，V00654牛与南阳牛和闽南牛亲缘关系最近，与宣汉牛关系较近，与鲁西牛关系较远。秦川牛、渤海黑牛、蒙古牛这三个种群为亲缘关系较近。 关键词：黄牛 线粒体 细胞色素B DNA 进化 Chinese ox mtDNA cyt b gene evolution analysis ???? zhanjing ?? （Tutor：Zhangrunfeng） （College of Life Sciences , Hubei Normal University, ?Huangshi, ） Abstract: Using molecular biological methods, combined with bioinformatics, the use of mitochondrial DNA sequence analysis and genetic relationship of Chinese cattle origin and evolution. Cattle multiple countries recognized that while at home and abroad, but also faced cattle breeds in the protection of genetic resources, so as soon as possible at the molecular level inherent in cattle breeds in China and the origin of the genetic relationship is very important to study evolution. Determination of the Qinling Mountains north of the cattle, Bohai Black, Mongolian beef, cattle, and cattle Xuanhan south of the Qinling Mountains, southern cattle, seven varieties of Nanyang cattle beef cattle and V00654 mitochondrial DNA cytochrome b gene frag