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FoxO1DNA复合物分子动力学模拟研究 　　 　　摘要：采用分子动力学分别模拟了ＦｏｘＯ１和两个不同的ＤＮＡ序列ＩＲＥ－ＤＮＡ、ＤＢＥ－ＤＮＡ结合形成的复合物结构。６ ｎｓ的分子动力学模拟结果表明，ＦｏｘＯ１／ＤＢＥ－ＤＮＡ系统较ＦｏｘＯ１／ＩＲＥ－ＤＮＡ系统更稳定，和试验中活性测试结果一致。两个系统的氢键计算显示，ＤＢＥ－ＤＮＡ在碱基Ｔｈｙ２、Ｇｕａ３和Ｔｈｙ７′上和ＦｏｘＯ１形成了更多的高占有率的氢键，使得ＤＢＥ－ＤＮＡ和ＦｏｘＯ１结合得更加紧密。通过比较ＤＮＡ构象参数，揭示了ＤＮＡ序列在５′端小沟的压缩以及３′端大沟的扩张是有利于和ＦｏｘＯ１结合的优势构象。为从原子水平上理解ＦｏｘＯ１的调控机理提供了一定的理论依据。 　　关键词：ＦｏｘＯ１；ＤＮＡ；分子动力学模拟；大沟；小沟 　　中图分类号：Ｑ５１；Ｑ５２文献标识码：Ａ文章编号：0439－８114（２０14）09－2184-05 　　 　　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｙｎａｍｉｃｓ Ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎs of ｔｈｅ ＦｏｘＯ１－ＤＮＡ Ｃｏｍｐｌｅｘｅｓ 　　 　　ＷＡＮ Ｈｕａ，ＣＨＡＮＧ Ｓｈａｎ 　　（Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ， Ｓｏｕｔｈ Ｃｈｉｎａ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ ５１０６４２， Ｃｈｉｎａ） 　　 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ