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一种基于SNN鲁棒性ISOMAP算法
一种基于SNN的鲁棒性ISOMAP算法
【摘 要】 流形学习的主要目标是发现高维观测数据空间中的低维光滑流形。论文考虑噪声点会导致数据集拓扑结构不稳定,不能得到较优的低维嵌入结果,给出一种基于共享近邻(Sharing Nearest Neighbors,SNN)的鲁棒性ISOMAP算法,并对提取到的噪声点低维映射给出了一种线性泛化公式。最后将算法应用于含噪声的Swiss-Roll数据集中,通过计算数据集量化标准――残差,验证了算法的可行性和有效性。
【关键词】 流形学习 共享近邻 鲁棒性ISOMAP 残差
论文结合共享近邻(Sharing Nearest Neighbors,SNN)算法思想,提出一种ISOMAP的鲁棒性改进算法,可以有效检测出数据集中的噪声点。首先完成除噪后数据集的低维映射,然后针对噪声点提出泛化公式完成噪声点的低维映射。最后通过对含噪声的Swiss-Roll数据集进行实验,并对映射数据集的残差进行量化,验证了算法的可行性和有效性。
1ISOMAP算法
ISOMAP是由Tenenbaum和Silva于2000年提出的,算法建立在经典的MDS(多维尺度变换)算法基础上,其目标是使降维后的数据尽量保持在降维前的数据间的邻接关系。传统MDS采用欧式距离来度量两点之间的距离关系,但在很多情况下欧式距离度量不能真正体现数据点集之间的真正距离关系。如图1(A)所示,直线为两点之间的欧式距离,曲线为两点沿曲面的距离(测地线距离),可以看出两点间测地线距离更符合数据点的距离关系度量。ISOMAP算法通过计算两点间的最短路经(图1(B)折线)来逼近两点间测地线距离(图1(B)直线),用两点间最短路经距离代替MDS中的欧式距离,完成高维空间到低维空间的映射。
具体的ISOMAP算法步骤可描述为:
Step1:建立加权邻接图G。主要有两种方法确定邻接图的边,ε邻域和k近邻,并以数据点间的欧氏距离作为边上的权重。
Step2:利用图论中的Dijkstra算法或Floyd算法计算图G中每两点间的最短路径,记得到的距离矩阵为DG={dG(i,j)}。
Step3:用MDS求低维嵌入坐标,记H=(Hij)=(δij-),S=(Sij)=(Dij2),则所求的d维嵌入坐标由τ(D)的最大的d个特征值所对应的特征向量给出。
图1 欧氏距离,测地线距离和最短路径
在给定数据集良好抽样且内在扁平的条件下,ISOMAP算法能成功运用,如对不含噪声的Swiss-Roll数据集来讲,在映射到低维平面后能得到一理想的矩形面(图1(b))。但是在绝大部分环境下数据集一般是含噪声的,ISOMAP算法首先需要构造数据点的邻接图,而噪声点的出现就直接影响了数据点的邻接关系图。由图2可以看出噪声点的出现破坏了原有数据点的邻接结构,当数据集中噪声点规模较大时,数据集中噪声点势必会破坏整个数据集的拓扑结构,进而会对整个降维映射过程产生较大影响。因此需要对这些噪声点进行处理来得到较为理想的低维映射结果。
图2 噪声点对数据集邻接图的影响
2基于SNN孤立点检测算法
共享最近邻聚类是一种整合了多种聚类思想的聚类方法,可以处理包含噪声、孤立点以及任意形状、大小、密度的子类的高维数据的聚类问题。同时SNN算法可以适用于高维数据的聚类问题,通常情况下,噪声点的邻接点较少,因此可以通过计算共享的最近邻来定义两个对象之间的相似性,并以此来检测噪声点。
设Ω为n维样本空间,点p,p∈Ω,点p的最近k近邻列表是表示与点p距离最近的k个点组成的集合,用nn[p]表示。(V,E)表示共享最近邻图。u,v当且仅当u∈nn[v]且时v∈nn[u]认定点u,v之间有连接;具体的两点间的连接强度可由下式来确定:
str(u,v)=Σ(k+1-m)*(k+1-n),um=vn(2.1)
str(u)=Σsum(str(u,v))(2.2)
根据(2.1)可以得到两点的连接强度矩阵,设定一定阈值,连接强度低于一定阈值的可视为噪声点的连接边,可以直接删除;通过(2.2)可以计算每个点的连接强度,对连接强度低于域值的可视为噪声点。图3(a)所示为含噪声点的不规则分布的数据点集,图3(b)中加号点为检测出的噪声点,可以看出基于SNN的孤立点检测算法效果良好。
图3 基于SNN的孤立点检测算法对各种数据集形状的数据点的检测结果
3基于SNN的鲁棒性ISOMAP算法
由基于SNN的孤立点检测算法在除噪中的应用,可以设计基于SNN的鲁棒性ISOMAP算法,对除噪后的数据集进行降维。
对噪声点的处理引入一个数据泛化公式进行处理,由于非线性映射算法泛化能力弱,不能找到直接的映
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