中药化学成分对大鼠急性毒性定量构效关系研究.docVIP

中药化学成分对大鼠急性毒性的定量构效关系研究 　　摘要：目的 探讨计算机毒性预测技术和方法，为中药安全性评价提供新的途径。方法 采用Mold2软件（version 2.0.0）对7409个中药化学成分进行分子描述符计算，初步筛选后采用随机森林算法进行定量构效关系（QSAR）模型构建，筛选出最优预测模型，并对2010年版《中华人民共和国药典》所载83个有毒中药中有化学成分单体结构报道的60种中药（1692个化学成分）进行急性毒性的预测。结果 经筛选，最终得到数据7409条。当描述符集合为52个时，随机森林算法建模模型准确度和Kappa值较高，分别为0.712和0.436；根据最优分子描述符集（52个）表征的化学空间距离将化合物聚类分为3类，第1类化合物最优模型的准确度和Kappa值分别为0.666和0.476，第2类化合物最优模型的准确度和Kappa值分别为0.804和0.381，第3类化合物最优模型的准确度和Kappa值分别为0.709和0.373。预测60种中药（1692个化学成分）中含剧毒化合物0个、高毒化合物2个、中毒化合物172个和低毒化合物1518个。结论 采用QSAR模型对中药化学成分进行急性毒性预测研究可为联合用药和进一步实验研究提供参考。 　　关键词：定量构效关系；预测模型；急性毒性；中药化学成分；大鼠 　　DOI：10.3969/j.issn.1005-5304.2016.01.010 　　中图分类号：R2-05；R285.5 文献标识码：A 文章编号：1005-5304（2016）01-0043-04 　　QSAR Study on Toxicity of Chemical Components of Chinese Materia Medica and Acute Toxicity of Rats LEI Lei1， WANG Xin-zhou2， ZHANG Li1， YANG Ce1， KANG Li1， ZHU Yong-liang2， QIAN Xiang-ping2， YE Zu-guang3 （1. Institute of Information on TCM， China Academy of Chinese Medical Sciences， Beijing 100700， China； 2. Suzhou Neupharma Co. Ltd.， Suzhou 215123， China； 3. Institute of Chinese Materia Medica， China Academy of Chinese Medical Sciences， Beijing 100700， China） 　　Abstract： Objective To study computer toxicity prediction technology and predict the acute toxicity of Chinese materia medica； To provide a new way and method for safety evaluation of traditional Chinese medicine. Methods First， Mold2 software （version 2.0.0） was used to calculate molecular descriptors of 7409 chemical components. After preliminary screening of molecular descriptors， quantitative structure-activity relationship （QSAR） models were built up with Random Forest （RF） for screening the optimum prediction model. From the 83 kinds of toxic Chinese materia medica in Chinese Pharmacopoeia （2010 edition）， acute toxicity of 60 kinds of Chinese materia medica reported from monomer structure （1692 chemical components） were under prediction. Results Totally 7409 pieces of data were obtained. When the descriptors were 52， RF modeling accur