应用abeem2fmm模型和量子化学方法研究mg22bca22b与dna碱基的相互作用.pdfVIP

辽。j。师范人学硕十学何论文 目 录 摘 要．………………………………………………………．．I 弓l 言+…………………………………………………………1 l基本理论………………………………………………………．3 1．1经典的电负性标度……………………………………………3 l。1．1Paul ing电负性………………………………………．．3 1．1．2Mull iken电负性………………………………………．3 1．1．3A1 1．1．4 60rdy电负性…………………………………………．5 1．1．5 1．1．6小结…………………………………………………6 1．2原子一键电负性均衡模型………………………………………6 1．3原子一键电负性均衡融合进分子力学……………………………．13 1．3．1分子力场作用项的一般形式………………………………13 1．3．2键长的伸缩振动………………………………………．13 1．3．3键角的弯曲振动………………………………………．14 1．3．4二面角扭曲相互作用能…………………………………．14 1．3．5Vander WaalS相互作用………………………………．．14 1．3．6静电相互作用…………………………………………14 2应用原子一键电负性均衡方法和量子化学方法研究镁、钙离子与DNA碱基单体的相互 作用……………………………………………………………16 2．1前言……………………………………………………．16 2．2量子化学方法……………………………………………．17 2．2．1位点的选取…………………………………………．17 2．2．2基组和方法的选择……………………………………．18 2．3．1 ABEEM／MM模型的表达式………………………………．．19 2．3．2模型电衙的精度………………………………………23 2．4结果与讨论………………………………………………．24 2．4．1几何构型……………………………………………．24 2．4．2结合能……………………………………………．．27 DNA碱基的相LI：作心 应用ABEEM／MM模型和颦子化学方法研究M92+／Ca2+雨l 2．4．3电荷分布……………………………………………：3() 2．5结论…………………………………………………．．．．：{2 3应用量子化学方法研究镁、钙离子与DNA碱基对的相互作用………………．33 3．1前。言……………………………………………………．33 3．2量子化学方法………………………．………………．．．．．．．3／l 3．2．1位点的选取…………………………………………．．34 3．2．2方法和基组的选取……………………………………．．35 3．3结果与讨论………………………………………………．35 3．3．1镁、钙离子与碱基对的距离………………………………35 3．3．2镁、钙离子对碱基对氢键键长的影响………………………．38 3．3．3结合能………………………………………………40 1 3．4结论…………………………………………………．．．．4 4碱金属离子在汞金属界面吸附作用的量子化学研究………………………42 4．1前言……………………………………………………．42 4．2计算方法………………………．………………………．．42 4．3模型的构建………………………………………………．42 4．4结果与讨论…………………………………