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基于NanoLCLTQOrbitrap技术蛋白质组学法探索人参干预气虚大鼠生物学基础
基于NanoLCLTQOrbitrap技术蛋白质组学法探索人参干预气虚大鼠生物学基础
[摘要] 应用NanoLCLTQOrbitrap技术的蛋白质组学法探索人参干预“气虚”大鼠的生物学基础。采用“限食+游泳过度”的方法建立气虚大鼠模型,运用NanoLCLTQOrbitrap纳升液相质谱联用检测系统分析空白组、气虚模型组、人参组大鼠股外侧肌肉组织全蛋白。Protein Discovery软件进行蛋白质鉴定,SIEVE软件对所有样本蛋白进行相对定量分析。人参组与模型组相比较共发现26个与空白组趋势一致的显著差异蛋白,通过生物学功能分析发现,其主要可归为能量代谢相关蛋白、糖代谢相关蛋白、电解质平衡及物质转运相关蛋白、炎症相关蛋白和细胞骨架相关蛋白等。以上相关蛋白靶点及其涉及的生物体调控通路可能是人参对机体“气虚”症候发挥补气作用的生物学基础。
[关键词] NanoLCLTQOrbitrap; 气虚; 人参; 蛋白质组学
中医基础理论认为:“气”是构成人体和维持人体生命活动的最基本物质,流转于全身各脏腑、经络等组织器官,不断的推动和激发着人体的各种生理活动[12]。“气”之不足,脏腑组织功能、机体活动则明显减退。现代医学研究亦表明,气虚与高血压、糖尿病、冠心病、慢性心衰、中风、急性脑梗塞、乳腺癌等多种疾病的发生有着密切的关系[23]。探索“气虚”症候及其治疗机制的科学内涵是中医中药现代化研究的重要内容。
人参为《神农本草经》首上品,“补五脏,安精神,定魂魄,止惊悸,除邪气,明目,开心益智”[4]。其大补元气之功,向来备受历代医家推崇。
蛋白质组学(proteomics)是一门大规模、高通量、系统化的研究某一类型细胞、组织或体液中的所有蛋白质组成及其功能的新兴学科[5],是继基因组之后又一重要生命科学研究领域,也是功能基因组时代的核心内容之一,为生物系统重要组成部分。其以“整体、系统”为特点的组学方式探索蛋白层面变化规律与中医症候“整体观”、中药治疗“多靶点”格局十分吻合[6]。
传统的蛋白质组学实验[7]采用基于双向电泳的蛋白质分离方法与常规质谱检测技术,难以实现真正意义上的高通量,高精准无缝衔接的组学研究。本实验在中医药理论指导下,采用NanoLC耦合LTQOrbitrap质谱检测系统,运用比较蛋白质组学方法寻找人参调节“限食+游泳过度”所致气虚动物的差异蛋白,结合生物学功能分析,探索人参大补元气的生物学基础。
1 材料
1.1 动物
SD大鼠,雌雄各半,体重230~250 g,SPF级,由湖南斯莱克实验动物有限公司提供,许可证号SCXK(湘
1.2 药品与试剂
人参颗粒(广东一方制药有限公司,批号401208T);乙腈(HPLC级,德国默克,批号JAO28730);甲酸(Sigmaaldrich,USA,批号BCBP4740V);RIPA高效裂解液(Thermo Pierce,批号QB212494);苯甲基磺酰氟(PMSF)(Thermo Pierce,批号QE2016716);二硫苏糖醇(Thermo scientific,批号QE217272A);碘代乙酰胺(Thermo scientific,批号QE216501);测序级胰酶(Promega,USA,批号0000153715);乙酸(HPLC级,Sigmaaldrich,USA,批号BCBN4472V);丙酮(HPLC级,国药集团,批;碳酸氢铵粉末Sigmaaldrich,USA,批号BCBN6056V);BCA蛋白定量试剂盒(Thermo scientific,USA,批号QH220534A)。
1.3 仪器
ORBITRAP ELITE质谱仪(Thermo公司);EASYnLC 1000液相仪(Thermo公司);分析天平(梅特勒公司);C18旋转柱 (Thermo Pierce公司);D37520高速冷冻离心机(赛默飞世尔科技有限公司);ELX800吸收光酶标仪(美国BioTek仪器有限公司);离心浓缩仪(LABCONCO,美国);EASYSpray Column(Thermo,美国);Acclaim PepMap 100(Thermo,美国)。
2 方法
2.1 实验造模、分组及给药[8]
实验前将所有动物进行预游泳,剔除差异大的动物,保留游泳时间在10~50 min的合格大鼠。将合格大鼠按体重随机分为空白组、气虚模型组、人参组,每组10只。除空白组外,其余大鼠每天上午8:00、晚上6:00置于恒温水槽[(23±1)℃,水深40 cm]中负重(8%)力竭(游泳最后下沉,经10 s后仍不能返回水面即为力竭)游泳,并隔日禁食,隔日按1
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