基于super―BSA技术开发甜瓜含糖量和酸度性状功能性分子标记.docVIP

基于super―BSA技术开发甜瓜含糖量和酸度性状功能性分子标记 　　摘 要： 为达到选育甜酸味品系、缩短育种周期、提高选择准确率的目的，本研究基于简化基因组测序（SLAF-seq）的选择性基因型鉴定和集群分离分析（Super-BAS），结合生物信息学方法，以‘风味4号’甜瓜F2群体甜味、酸味、不甜不酸3个极端表型群体为试验材料，精细定位甜瓜含糖量、酸度性状相关基因并开发功能性标记。结果显示：（1）将甜瓜含糖量、酸度性状定位在双亲基因组；（2）获得1个含糖量性状相关候选基因，3个酸度性状相关候选基因；（3）针对候选基因开发出1个含糖量性状相关基因功能性分子标记SLAF18745-S01和3个酸度性状相关基因功能性分子标记SLAF36334-S02、SLAF50072-S03和SLAF31212-S04。本研究开发的功能性分子标记为甜瓜品质性状基因的分子标记辅助选择提供了重要的标记基础。 　　关键词： 甜瓜； 含糖量； 酸度； 精细定位； 功能分子标记 　　Abstract： SLAF-seq-based selective genotyping and bulked segregant analysis（Super-BSA），together with bioinformatic methods were performed in three extreme phenotypes populations（sweetness，acidity and neither sweet nor sour） from the F2 population of a flavorful melon（Cucumis melo L.） ‘Fengwei No. 4’； fine mapping of its genes related to sugar content and acidity traits was achieved and functional markers were developed. Results showed that：（i） both sugar content and acidity traits were mapped in parental genome；（ii） one sugar content trait-related candidate gene and three acidity trait-related genes were obtained；（iii） one sugar content（SLAF18745-S01） and three acidity （SLAF36334-S02，SLAF50072-S03 and SLAF31212-S04）trait-related gene functional molecular markers were developed based on the candidate genes. In conclusion，the functional molecular markers developed in this study provide an important marker foundation for molecular marker-assisted selection of quantitative trait loci of melons，which can reduce breeding cycles and improve the accuracy of selection. 　　Key words： Melon； Sugar content； Acidity； Fine mapping； Functional molecular markers 　　甜瓜（Cucumis melo L.）属葫芦科甜瓜属，是一种重要的园艺作物，我国甜瓜的种植面积和产量均居世界第一。甜瓜是一种高多态性物种，含有各种不同果实风味的基因型[1-3]。 　　大多数果实的风味由糖、有机酸及果实特征香气组成，糖含量是影响甜瓜果实品质的主要因子[4]，蔗糖是甜瓜果实成熟所积累的主要成分[5-7]。甜瓜栽培种果实有机酸含量很低，但甜瓜种（Cucumis melo）中存在高有机酸含量的遗传变异[8-11]。近年来，育成了具有独特酸甜味的甜瓜栽培种[12-14]。甜、酸等风味的变化是一个复杂的过程，受一系列相关基因的影响和调控[15]。定位甜瓜含糖量、酸度性状相关基因并开发功能性标记，为提高甜瓜果实品质性状选育效率及甜瓜分子育种提供思路。在现有甜瓜育种实践中，对含糖量、酸度等风味性状大多是通过表现型间接对基因型进行选择，致使育种周期长，效率低，制约着甜瓜品种改