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基于粗糙集和C4.5决策树临床病例数据分类研究
基于粗糙集和C4.5决策树临床病例数据分类研究
摘要:C4.5 算法是数据分类的经典数据挖掘算法。整合并规范了临床确诊病例中的糖尿病并发症数据,同时进行了粗糙集约简,并运用C4.5算法实现了分类。研究表明,该方法能很好地实现决策分类,以辅助临床诊断。
关键词关键词:粗糙集;C4.5算法;数据分类;糖尿病并发症
中图分类号:TP312文献标识码:A文章编号文章编号2014)005006104
基金项目基金项目:江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ13014);江西省卫生厅中医药科研课题(2013A065)
作者简介作者简介:王卓(1979-),女,硕士,南昌大学软件学院讲师,研究方向为数据挖掘。0引言
粗糙集理论[1]是一种新的处理模糊和不确定性知识的数学工具,其主要思想是在保持分类能力不变的前提下,通过知识约简[26],导出问题的决策或分类规则。粗糙集能约简、去噪,对数据预处理起到了很好的作用。
分类[78]是数据挖掘中一项非常重要的任务。数据分类通常是指在已有训练样本数据、类标签为已知的基础上,根据某种算法或原理,经过训练学习而建立分类模型,然后使用分类模型判断其它未分类数据的类别。分类模型可以表示为分类规则形式、决策树形式、数学公式形式等。
决策树[9]是以实例为基础的归纳学习算法。它是一种从一组无次序、无规则的事例中推理出决策树形式的分类规则,然后对输入数据进行分类。其关键问题在于决策树的构建过程,包括建树和剪枝两个步骤。建树:采用自顶向下的递归方式,对决策树内部的节点进行属性值比较,并根据不同属性值来判断该节点向下的分支;在建立决策树的过程中需要设置停止增长条件,以使决策树能在适当的时候停止生长。剪枝:考虑把决策树修剪到合适的尺寸,并尽量保持决策树的准确度。C4.5算法属于决策树分类算法。
1粗糙集基本理论
信息系统[1,45]可以定义为S=(U,A∪D),其中U是一个非空、有穷、称为全域的个体集合,A是非空、有穷条件属性集合,即对于属性a∈A,有a:U→V,其中Va是属性a的值集,集合V=∨a∈AVa 称为属性A的值区域,D称为决策属性集。
属性约简:对于一个决策信息系统,条件属性中的各个属性间往往存在某种程度的关联或依赖,相对于决策属性来说,某些条件属性可能是冗余的。对属性的约简[4]就是用最基本的条件属性集代替原来的条件属性集,而不影响原有的功能。
定义1:设R是一个等价关系族,r∈R,如果IND(R)=IND(R-{r}),则称r在R中是可被约去的知识;如果P=R-{r}是独立的,则P是R中一个约简。
定义2:如果任一个r∈R是R中不可约去的,则等价关系族R是独立的;否则R是相关的。
定义3:R中所有不可约去的关系称为核,由它构成的集合称为R的核集,记成CORE(R)。
简化分明矩阵属性约简法[45],是一边从信息系统S=(U,A∪D)中提取属性值是分明的属性并构造成分明合取范式,一边作这种逻辑公式的等价变换,直接得到最小析取范式,它对应于该信息表的约简。
2C4.5算法
2.1算法思想
首先C4.5泛指基本的C4.5、C4.5nopruning 以及拥有多重特性的C4.5rules等多变体的一系列算法。
基本的C4.5算法[10]思想是采用构造决策树的方法,实现分类。所有树的构造过程遵循自上而下递归模式。根节点表示一个给定的数据集;从根节点开始,每个节点用信息增益率等度量方法,测试一个特定的属性,把节点数据集划分成更小的子集(中间节点),并用子树表示;递归划分节点,直到子集成为“纯”的叶节点,即子集中的所有实例都属于某信息粒度时的同一类别,树才停止增长。C4.5算法构造决策树结构如图1所示。
图1C4.5算法构造决策树结构
2.2C 4.5算法相关理论
C4.5算法相关知识[1112]如下:
(1)属性值分析的数据是平面文件形式,一个对象或样本的所有信息要用固定属性集来表达。每个属性的值可以是数值型或离散型,但是用于描述样本的属性时不允许重复。
(2)分配给样本的类别必须是已知的;对于离散型样本数据,一个样本属于且仅属于其中的一类;样本的个数要远远超过类数。
定义4:给定一个训练数据集D={d1,d2,…dn},其中每个实例di=,th称为例子,训练集中包含属性A={A1,A2,…Ah},类别集C={C1,C2,…Cm}。对于训练集D,决策树是指具有以下性质的树:①每个内部节点都被标记一个属性Ai;②每条弧都被标记一个值vk,这个值vk对应于相应的父节点的属性;③每个叶节点都被标记一个类Cj。
定义5:分裂准则qi定义为在决策树算法中
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