灵长目动物中ACVRIIB蛋白及其基因的比较研究毕业论文正文.docx

PAGE \* MERGEFORMAT1 灵长目动物中ACVRIIB蛋白及其基因的比较研究 利用动物构建人类基因同源模型是现代生物医学领域研究的重要方法。与小白鼠、家兔、鸡、鱼、羊等动物不同，灵长类动物与人类在基因、脑功能、揭破结构、行为和认知功能、代谢过程以及生殖方式等方面的接近程度是其他实验动物无法比拟的。因此灵长类动物的对比提供了一个理想的参考点。 激活素信号通过不同的复杂的丝氨酸激酶受体包括至少两个I型（I和IB）和II型（II和IIB）受体。这些受体都是跨膜蛋白，组成的配体结合的胞外结构域与富含半胱氨酸的区域，一个跨膜结构域，和一个细胞质域与预测的丝氨酸/苏氨酸特异性。Ⅰ型受体是必不可少的信号转导；Ⅱ型受体是必需的结合配体和表达Ⅰ型受体。Ⅰ型和Ⅱ型受体在配体结合后形成一个稳定的复合物，导致Ⅰ型受体的磷酸化。Ⅱ型受体被认为是组成性激活激酶。 同时，ActR IIB(activin receptor type IIB)是肌肉生长抑制素(Myostatin)的一种受体，和Myostatin有很高亲和力，Myostatin—ActR IIB—Smad信号途径对肌肉生长其重要的负调控作用。且有报道称ActR IIB的缺失对肌肉生长的促进作用要比myostatin缺失的作用更为显著。 通过ncbi检索灵长类同源蛋白的共得到10种灵长目动物，分别是苏门答腊猩猩Pongo abelii、仰鼻猴Rhinopithecus roxellana、白颊长臂猿Nomascus leucogenys、克氏狐冕猴Propithecus coquereli、安哥拉疣猴Colobus angolensis palliatus、大猩猩Gorilla gorilla、菲律宾跗猴Tarsius syrichta、亚马逊松鼠猴Saimiri boliviensis boliviensis、安第斯夜猴Aotus nancymaae、普通狨Callithrix jacchus。利用这十种灵长目动物的ACVRIIB蛋白与人类ActRIIB蛋白进行比较研究。 本文利用生物信息学方法，分析与人类肌肉生长密切相关的ActR IIB蛋白在灵长目动物中的同源蛋白ACVRIIB及基因与结构，旨在通过对灵长类ACVRIIB蛋白的研究为人类肌肉生长的相关研究提供一定的依据。 1 分析方法 1.1 灵长目动物ACVR IIB蛋白的基因结构分析 在GenBank数据库（http：///）中，搜索人类ActR IIB蛋白在灵长目动物中的同源蛋白，再分析其基因中的内含子和外显子信息。 1.2 灵长目动物ACVR IIB蛋白的蛋白质理化性质分析 利用互联网上提供的ExPaSy服务器( HYPERLINK /tools/protparam.html /tools/protparam.html)，通过ProtParam工具，进行蛋白质的氨基酸组成、分子质量、等电点以及疏水性分析。 1.3灵长目动物ACVRIIB蛋白的二级结构分析 利用SOPM对灵长目动物ACVR IIB蛋白的二级结构进行分析。（ HYPERLINK http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html） 1.4 灵长目动物ACVRIIB 蛋白的三级结构分析 1.5 灵长目动物ACVRIIB 蛋白的功能分析 1.6 构建系统进化树 选取灵长目动物的同源蛋白，构建系统进化树。 2 结果与分析 2.1 灵长目动物ACVR IIB蛋白的基因结构分析 通过ncbi检索灵长类同源蛋白的共得到10种灵长目动物，分别是苏门答腊猩猩Pongo abelii、仰鼻猴Rhinopithecus roxellana、白颊长臂猿Nomascus leucogenys、克氏狐冕猴Propithecus coquereli、安哥拉疣猴Colobus angolensis palliatus、大猩猩Gorilla gorilla、菲律宾跗猴Tarsius syrichta、亚马逊松鼠猴Saimiri boliviensis boliviensis、安第斯夜猴Aotus nancymaae、普通狨Callithrix jacchus。利用ncbi（ HYPERLINK ）得到上述10种灵长目动物的基因结构分析。 苏门答腊猩猩、仰鼻猴、白颊长臂猿、克氏狐冕猴和普通狨的ACVRIIB蛋白的基因均具有11个外显子，亚马逊松鼠猴和安第斯夜猴的ACVRIIB蛋白的基因具有12个外显子，安哥拉疣猴和大猩猩的ACVRIIB蛋白的基因则具有17