猪sirt2 pparδ suv39h12基因的snps检测及性状关联分析-snps detection and trait correlation analysis of porcine sir t2 ppar δ suv 39h12 gene.docxVIP

万方数据 万方数据 独 创 性 声 明 本人声明，所呈交的学位论文，在指导教师指导下，通过我的努力取得的成果， 并且是自己撰写的。尽我所知，除了文中作了标注和致谢中已经作了答谢的地方外， 论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果，也不包含在浙江农林大学或其他教 育机构获得学位或证书而使用过的材料。与我一同对本研究做出贡献的同志，都在 论文中作了明确的说明并表示了谢意。如被查有严重侵犯他人知识产权的行为，由 本人承担应有的责任。 学位论文作者亲笔签名： 日 期： 论文使用授权的说明 本人完全了解浙江农林大学有关保留、使用学位论文的规定，即学校有权送交 论文的复印件，允许论文被查阅和借阅；学校可以公布论文的全部或部分内容，可 以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 保密，在 年后解密可适用本授权书。□ 不保密，本学位论文属于不保密。 □ (请在方框内打“√”) 学位论文作者亲笔签名： 日 期： 指导教师亲笔签名： 日 期： 摘要 摘要 万方数据 万方数据 摘要 分子标记辅助选择(marker assisted selection, MAS)糅合传统育种方法，在动物遗传 育种过程中得到了广泛应用。这种方法使得猪遗传改良的进程加快，在猪育种工作 中占据愈加重要的作用。寻找并选择与猪的生产或繁殖性状相关的主效基因，是分 子标记辅助选择的基础。本研究选取了 NAD+依赖性去乙酰酶沉默信息调节因子 -2(NAD ＋ -dependent deacetylase sirtuin-2, Sirt2)、过氧化物酶体增殖物激活受体 δ(Peroxisome proliferator activated receptors δ, PPARδ) 、 花 斑 抑 制 因 子 同 源 物 1/2(suppressor of variegation 3-9 homolog1/2, Suv39h1/2)个候选基因进行了研究。实验 中，以猪毛囊为试验材料提取了 537 份长白猪、50 份约克夏基因组 DNA，另有实 验室保存的 36 份杜洛克猪、24 份嵊县花猪和 50 份嘉兴黑猪的基因组 DNA，设计 引物，通过 PCR 扩增得到各个基因位于外显子的部分序列，测序比对筛选各基因 SNPs 并对其等位基因频率和基因型频率以及 Hardy-Weinberg 平衡状态做了分析。 对 537 只长白猪中得到的 SNPs 与部分生产性状进行关联分析。 获得结果如下： 1. Sirt2 基因的表达产物为一种保守的 NAD+依赖性去乙酰酶沉默信息调节因 子，试验中于目的片段测序区共得到 4 个 SNPs：59A/C、303A/G、350C/G 和 488A/G。 测序峰图显示每个 SNP 处都有三种基因型，分别命名为 AA、AB、BB、CC、CD、 DD、EE、EF、FF、GG、GH 和 HH。卡方检验表明，59A/C 和 303A/G 两个基因座 均处于 Hardy-Weinberg 平衡状态，350C/G、488A/G 显著偏离平衡状态。59A/C 和 303A/G 六种基因型与长白猪生产性状关联分析结果表明，AA 型个体初生重显著高 于 AB 和 BB 型个体(P＜0.05)；DD 型个体平均日增重极显著高于 CD 型个体(P＜ 0.01)，显著优于 CC 型个体(P＜0.05)。 2. PPARδ 基因的表达产物过氧化物酶体增殖物激活受体是核激素受体超家族成 员，试验中于目的片段测序区共得到 1 个 SNP：69586A/G，测序峰图显示三种基因 型，分别命名为 II、IJ 和 JJ。卡方检验表明，此位点显著偏离 Hardy-Weinberg 平衡 状态，性状关联分析结果显示，JJ 型个体背膘厚显著优于 II、IJ 型个体(P＜0.05)。 I 3. Suv39h1 基因的表达产物是组蛋白甲基化转移酶家族的一个成员，试验中于 目的片段测序区得到 2 处 SNPs：655A/G、920C/T，测序峰图显示六种基因型，分 别命名为 KK、KL、LL、MM、MN 和 NN。卡方检验表明，两位点均极显著偏离 Hardy-Weinberg 平衡状态，性状关联分析结果显示，KK、KL 和 LL 型个体之间均 无显著差异；MM 型个体 100 kg 日龄显著低于 MN、NN 型个体(P＜0.05)。 4. Suv39h2 基因是组蛋白甲基化转移酶家族的一个成员，试验中目的片段测序 区得到 1 个 SNPs：23301C/G，测序峰图显示三种基因型，分别命名为 OO、OP 和 PP。卡方检验表明，此位点极显著偏离 Hardy-Weinberg 平衡状态；性状关联分析结 果显示，OP 型个体断奶重显著优于 OO、PP 型个体(P＜0.05)。 关键词：猪，去乙酰酶沉