【毕业论文】6个绵羊类群Callipyge和CAPN1基因多态性及其与生长性状的相关性研究.doc

甘肃农业大学2009届硕士学位论文 PAGE 分类号 密 级 U D C 单位代码 10733 甘肃农业大学 硕士学位论文 6个绵羊类群Callipyge和CAPN1基因 多态性及其与生长性状的相关性研究 Study on the Polymorphisms of Callipyge and CAPN1 Gene and their Relationships with Growth Quality Traits in Six Sheep Strains 指导教师姓名 教授 （甘肃农业大学 兰州 730070） 学科专业名称 动物遗传育种与繁殖 研 究 方 向 动物遗传学理论与应用 论文答辩日期 2010年6月5日 学位授予日期 2010 年6月 2010年6月 甘肃农业大学2010届硕士学位论文 Study on the Polymorphisms of Callipyge and CAPN1 Gene and their Relationships with Growth Quality Traits in Six Sheep Strains By Liu Xiaomin A Thesis Submitted To Gansu Agricultural University in Partial Fulfillment of the Requirements For Master Degree Supervisor: Prof. Zhang Liping Faculty of Animal Science Technology Gansu Agricultural University, Lanzhou, P.R China 730070 Commencement in June, 2010 甘肃农业大学2010届硕士学位论文 PAGE I 摘 要 本研究以欧拉型藏羊、甘加型藏羊、乔科型藏羊、陶塞特羊、德国美利奴和小尾寒羊6个绵羊类群共计404个个体为研究对象，利用PCR-SSCP技术，对Callipyge基因包括CLPGSNP位点的序列和CAPN1基因部分序列进行多态性检测，探讨这两个候选基因在6个类群中的遗传多态性，并利用最小二乘线性模型分析其与生长性状（体重、体长、体高、胸围和胸深）的相关性，为绵羊选育提供分子遗传学理论依据。结果如下： 1、对Callipyge基因P引物PCR-SSCP检测结果表明：6个绵羊类群中共检测到AA、AB和BB三种基因型，均以AA型为优势等位基因型，A为优势等位基因。测序结果显示在扩增片段的176bp处存在一个C→T的突变。 2、对CAPN1基因L1引物PCR-SSCP检测结果表明：6个绵羊类群中均检测到AA、BB和AB三种基因型，除陶塞特羊中A为优势等位基因，其余类群B为优势等位基因，测序结果显示CAPN1-L1扩增片段的190bp存在一个A→G突变，位于第5内含子，260bp处存在一个A→G突变，位于第6外显子，且该突变没有引起氨基酸的突变，属于同义突变。 3、对CAPN1基因L2引物PCR-SSCP检测表明：6个绵羊类群中共检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC 6种基因型，但仅在欧拉羊中检测到CC基因型，均以A为优势等位基因。测序结果显示在扩增片段的21bp处发生一个A→G、24bp处发生一个T→C、42bp处发生一个G→A、 122bp处发生一个G→A、146bp处发生一个C→T的突变，后两个突变位于第9外显子，但没有引起氨基酸的突变，为同义突变。 4、遗传特性分析得知：6个绵羊类群中Callipyge基因所检测的多态位点杂合度较低，属低度多态，X2适合性检验表明除小尾寒羊外，其余群体均处于Hardy-Weinberg平衡（P0.05）状态。6个绵羊类群中CAPN1基因中所检测的CAPN1-L1和CAPN1-L2多态位点杂合度较高，均属中度多态，X2适合性检验表明：陶塞特羊在所检测的L1和L2多态位点处均处于Hardy-Weinberg非平衡（P0.05）状态，其余绵羊类群均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P0.05）。 5、利用最小二乘线性模型进行多态位点与生长性状相关性分析，结果表明：Callipyge基因所检测的多态位点与生长性