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棉花应答逆境胁迫蛋白质组学研究进展 　　摘要：蛋白质组学是近年来随着人类基因组计划完成而逐步兴起的生命科学领域的又一研究热点。本文系统综述了棉花盐碱胁迫、低温胁迫、干旱胁迫和病害胁迫的蛋白质组学研究进展，并对利用蛋白质组学深入研究棉花与各种逆境互作的分子机制进行展望。 　　关键词：棉花；逆境胁迫；分子机制；应答；蛋白质组学；研究进展 　　中图分类号： S562.01；Q785文献标志码： A[HK] 　　文章编号：1002-1302（2016）12-0022-02[HS）][HT9.SS] 　　收稿日期：2015-11-10 　　基金项目：[JP2]棉花生物学国家重点实验室开放课题（编号：CB2014A16）。 　　作者简介：吴巧娟（1978―），女，浙江浦江人，硕士，从事棉花资源创新利用研究。E-mail：luyuewu@163.com。 　　通信作者：肖松华，研究员。E-mail：njxsh@。 　　棉花是世界主要的经济作物和天然纤维作物，也是研究植物纤维发育最为理想的模式作物，同时又具有较强的耐盐性，是改良盐碱地较为理想的先锋作物。蛋白质组学是近年来随着人类基因组计划完成而逐步兴起的生命科学领域又一研究热点。蛋白质组（proteome）的概念最先由MarcWilkins提出，是指由一个基因组（genome）或一个细胞、组织表达的所有蛋白质（protein）[1]。近年来，许多学者相继开展棉花基因组学、转录组学、蛋白?|组学等方面的研究，并取得了一些进展。本文较为系统地回顾了棉花逆境胁迫应答的蛋白质组学研究进展，为利用蛋白质组学技术深入研究棉花应对逆境胁迫的分子机理奠定了理论基础。 　　1逆境胁迫的蛋白质组学研究 　　植物在生长发育过程中，经常会遭受病菌、害虫等生物胁迫和低温、干旱和盐碱等非生物胁迫。由于这些不良环境条件对植物生长发育或繁殖产生负面影响，因此植物自身在遭遇、适应这些胁迫过程中产生一系列应答反应，并引起多个相关通路的蛋白发生种类和表达量变化。 　　1.1棉花高盐胁迫的蛋白质组学研究 　　盐胁迫与植物生理和代谢密切相关，是影响植物生长发育最主要的非生物胁迫之一。然而，目前世界上约20%的耕地和50%的灌溉地正在遭受盐分的影响，土壤盐渍化是目前制约农业生产的一个全球性问题。棉花具有较强的耐盐性，其中非洲棉和海岛棉的耐盐性优于陆地棉和亚洲棉。近年来，国内外研究者利用蛋白质组学围绕棉花耐盐机理等方面开展了大量研究，并取得了很大进展。 　　双向电泳（two-dimensional electrophoresis，2-DE）技术是目前较为常用的分离蛋白质的重要技术，研究者利用双向电泳技术对棉纤维发育机理进行探索[2-4]，确定“-3 DPA”是纤维起始发育的开始，并发现了众多与棉纤维发育相关的蛋白质。当前，也有研究者利用双向电泳技术分离棉花耐盐相关蛋白质的报道[5-9]。研究者主要围绕棉花叶片蛋白质组双向电泳的技术条件进行优化，并分离到涉及光呼吸、细胞防御以及氨基酸代谢等信号途径中的蛋白质。 　　同位素标记相对和绝对定量（isobaric tags for relative and absolute quantitation，iTRAQ） 技术可以利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量，是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。周仲华等基于iTRAQ技术，针对采用漂浮育苗、传统营养钵育苗分别进行鉴定、比较分析，确定枯草杆菌酶家族蛋白（subtilase family protein）、α/β水解酶（alpha/beta-Hydrolases）、超家族蛋白（superfamily protein）等6个与棉花水浮育苗适应性高度相关的棉花耐涝渍关键基因。而王丽等同样利用iTRAQ技术鉴定出169个与棉花苗期与水分胁迫相关的差异蛋白，且发现磷酸果糖激酶（phosphofructokinase1）等糖酵解途径中的蛋白在漂浮育苗根系中比营养钵育苗根系中表达量更高[10]。许菲菲也运用iTRAQ技术对NaCl不同胁迫时期下蛋白质的差异进行了研究，结果鉴定出121个差异蛋白，并发现盐敏感品系“被动”抵抗盐胁迫，而耐盐品系则通过信号转导以及清除活性氧“主动”抵抗盐胁迫伤害，有助于进一步揭示棉花耐盐分子机制[11]。 　　1.2棉花低温胁迫的蛋白质组学研究 　　植物响应低温胁迫是一个复杂的网络调控反应，众多低温响应蛋白在此网络途径中起重要作用。目前，也有许多有关运用蛋白质组学技术研究棉花低温胁迫的分子机制的研究报道[12-14]。邰付菊等对5日苗龄的棉花于4 ℃下处理12 h，利用2-DE技术得到49个显著差异的蛋白点，其中