生物项目数据库(BioProject)使用说明-BIGDataCenter.PDFVIP

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生物项目数据库(BioProject)使用说明 数据库简介2 用户注册2 BioProject 创建3 1 数据库简介 生物项目数据库(BioProject)是收集与共享生物学研究项目信息的资源库, 涵盖的项目类型包括常规组学研究的基因组、转录组、表观组和宏基因组等,并 针对大型项目提供高效、安全、专业化的项目分级管理。 用户注册 用户可借助于中心单点登录(BIG Single Sign-On,BIG SSO)技术,通过BIG Submission 主页/gsub/完成用户账号注册,建议使用实验室公 共邮箱进行注册。如果您在账号使用过程中遇到任何问题,请联系 bigd- admin@。 2 BioProject 创建 账户注册完成后,即可进入 BIG Sub 统一递交入口,目前BIG Sub 已集成 BioProject 、BioSample 、GSA 、GWH 、GVM、BioCode 等数据库的提交接口, 如 果用户需要向递交组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive)、基因组序 列库(Genome Warehouse )、或基因组变异数据库(Genome Variation Map )等数 据库递交数据 (BioCode 数据库除外),都必须先进入 BioProject 数据库创建 BioProject 并完成相关信息填写,具体操作步骤如下: 注:如果用户需要向生物信息工具库(BioCode )递交开源生物信息软件工具,可直接进入BioCode 数据 库按步骤进行工具递交。 3 Release Date 的设置时间,用户可根据项目需求进行设 定,但最长不要超过2 年。 目前本系统Umbrella Project 功能只对中国科学院战略 性先导科技专项开发,其他项目此项不必填写。 请选出项目资金来源机构 注:eGPS :evolutionary Genotype-Phenotype biology 为先导B 动物复杂性状的进化解析与调控项; MMDB :Molecular Module-based Designer Breeding System 为先导A 分子模块设计育种创新体系项目。 4 Project Data type 支持多选,Project Data type 列表中不包 括的测序类型,可以选择 others 并在 Project Data type description 中自行添加。 Monoisolate :同一物种且同一基因型样本,主要用于模式动物/植物或细胞系等。 Multiisolate :同一物种的多基因型的个体样本 Multi-species :多物种样本集 Environment :环境样本集,样本的种类含量尚不清楚,多用于宏基因组研究 Synthetic :在实验室里制造/合成的样本 Single cell :单个细胞测序得到的序列信息 Other :其他样本/ 无法归入以上类别的特殊样本 5 点击 Submit

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