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生物项目数据库(BioProject)使用说明-BIGDataCenter.PDF
生物项目数据库(BioProject)使用说明
数据库简介2
用户注册2
BioProject 创建3
1
数据库简介
生物项目数据库(BioProject)是收集与共享生物学研究项目信息的资源库,
涵盖的项目类型包括常规组学研究的基因组、转录组、表观组和宏基因组等,并
针对大型项目提供高效、安全、专业化的项目分级管理。
用户注册
用户可借助于中心单点登录(BIG Single Sign-On,BIG SSO)技术,通过BIG
Submission 主页/gsub/完成用户账号注册,建议使用实验室公
共邮箱进行注册。如果您在账号使用过程中遇到任何问题,请联系 bigd-
admin@。
2
BioProject 创建
账户注册完成后,即可进入 BIG Sub 统一递交入口,目前BIG Sub 已集成
BioProject 、BioSample 、GSA 、GWH 、GVM、BioCode 等数据库的提交接口, 如
果用户需要向递交组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive)、基因组序
列库(Genome Warehouse )、或基因组变异数据库(Genome Variation Map )等数
据库递交数据 (BioCode 数据库除外),都必须先进入 BioProject 数据库创建
BioProject 并完成相关信息填写,具体操作步骤如下:
注:如果用户需要向生物信息工具库(BioCode )递交开源生物信息软件工具,可直接进入BioCode 数据
库按步骤进行工具递交。
3
Release Date 的设置时间,用户可根据项目需求进行设
定,但最长不要超过2 年。
目前本系统Umbrella Project 功能只对中国科学院战略
性先导科技专项开发,其他项目此项不必填写。
请选出项目资金来源机构
注:eGPS :evolutionary Genotype-Phenotype biology 为先导B 动物复杂性状的进化解析与调控项;
MMDB :Molecular Module-based Designer Breeding System 为先导A 分子模块设计育种创新体系项目。
4
Project Data type 支持多选,Project Data type 列表中不包
括的测序类型,可以选择 others 并在 Project Data type
description 中自行添加。
Monoisolate :同一物种且同一基因型样本,主要用于模式动物/植物或细胞系等。
Multiisolate :同一物种的多基因型的个体样本
Multi-species :多物种样本集
Environment :环境样本集,样本的种类含量尚不清楚,多用于宏基因组研究
Synthetic :在实验室里制造/合成的样本
Single cell :单个细胞测序得到的序列信息
Other :其他样本/ 无法归入以上类别的特殊样本
5
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