微生物研究探究进展chapter5 分子生态学方法在环境微生物研究探究领域的运用.pptVIP

1、传统培养法的瓶颈 微生物多样性被用于监视和预测环境变化,也是新基因资源的重要来源。传统纯培养技术虽然已经帮助人们认识了很多微生物，创造了巨大的财富，但是由于 什么原因？ 各种环境中能纯培养的微生物种类非常有限，远远不能反映出自然界微生物多样性的丰度和范围。 2、微生物分子生态学的产生 3、微生物分子生态学的概念 1、研究路线 2、荧光原位杂交（ FISH ） 2、基于16S rDNA的指纹图谱法 方法： ⑴ 构建16S rDNA克隆文库 16S rDNA克隆文库数据分析 ⑵ 变性梯度凝胶电泳DGGE 16S rDNA的高可变区 DGGE的参数： 环境样品分析的流程 DGGE在微生物分子生态学中的应用 举例： RFLP（限制性片段长度多态性） T-RFLP（末端限制性片段长度多态性） 三、展望 存在的问题： 对微生物群落结构进行对比、分析或者跟踪监测。 通过扩增功能基因来研究功能基因及功能菌群的 多样性。 跟踪及检测细菌的富集和分离，评价不同的培养 条件对分离菌种的影响。 油藏古细菌 V3区 DGGE 图谱 胶浓度：10% 变性剂范围：40%-60% 电压：200V 运行时间：4.5h 优点： 缺点： 分辨率有限，复杂环境中（土壤或肠道），只能检测出优势菌。 一般只能分析500bp以下的片段。 PCR过程产生的异源双