小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆生物信息学及-华南农业大学学报.PDFVIP

小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆生物信息学及-华南农业大学学报.PDF

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小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆生物信息学及-华南农业大学学报

 华南农业大学学报 2014,35(5):8892 http: xuebao.scau.edu.cn ∥             JournalofSouthChinaAgriculturalUniversity doi:10.7671/j.issn.1001411X.2014.05.015  龙翔宇,蒲至恩,杨丽娟,等.小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆、生物信息学及表达特性分析[J].华南农业大学学报,2014,35(5):8892. 小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆、生物信息学 及表达特性分析 1 2 2 2 2 龙翔宇 ,蒲至恩 ,杨丽娟 ,郑 科 ,刘泽厚 (1中国热带农业科学院橡胶研究所,海南儋州571737;2四川农业大学 小麦研究所,四川 成都611130) 摘要:【目的】克隆小麦Triticumaestivum晚期胚胎发育丰富蛋白基因并对其进行基因结构、蛋白特性及表达模式分 析,为其耐盐性研究奠定理论基础.【方法】搜索小麦EST数据库,通过同源克隆分离并获得小麦晚期胚胎发育丰富 蛋白基因,用生物信息学软件分析该基因结构及蛋白特性,荧光定量试验分析该基因的表达模式.【结果和结论】获 得1条1100bp的核苷酸序列,该序列包含了1个981bp的开放阅读框,编码 1个由326个氨基酸残基组成的蛋 白,该蛋白含有2个LEA2结构域,属于第2组LEA蛋白,该蛋白命名为TaLEA2.生物信息学分析显示TaLEA2蛋 白具有LEA2家族的典型特征,富含赖氨酸(Lys),不含半光氨酸(Cys),无明显的高级结构,平均亲水系数(GRA VY)为-0405,稳定系数为2528,这种氨基酸组成及结构均有利于蛋白的热稳定性及亲水性.实时荧光定量PCR 分析表明,TaLEA2基因为组成型表达,同时该基因存在组织表达差异,且表达受不同发育时期影响;该基因调控表 达受高盐、低温、病原菌及干旱等胁迫的影响,尤其在干旱胁迫中上调表达明显,但该基因不受外源ABA刺激的影 响.推测TaLEA2基因参与了小麦正常条件下的生长发育,同时也广泛地参与了小麦抵御逆境胁迫的响应,尤其在 小麦的抗旱胁迫过程中发挥重要作用. 关键词:小麦;TaLEA2基因;基因克隆;生物信息学;基因表达 中图分类号:Q349.53      文献标志码:A     文章编号:1001411X(2014)05008805 Molecularcloning,expressionandbioinformaticanalysis ofTaLEA2genefromwheat 1 2 2 2 2 LONGXiangyu,PUZhi′en,YANGLijuan,ZHENGKe,LIUZehou (1RubberResearchInstitute,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences,Danzhou571737,China; 2WheatInstitute,SichuanAgriculturalUniversity,Chengdu611130,China) Abstract:【Objective】Thecloning,expressionandbioinformaticanalysisofTaLEA2genewerecarried outtolaythetheoreticalbasisforsalttoleranceofwheat.【Method】TheTaLEA2genewasobtainedby homologycloning.It

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